Abstract A016: Cascade Failure in Lynch Syndrome Diagnosis: A Single-Institution Analysis
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Early-onset colorectal cancer (EOCRC) and endometrial cancer (EC) are defining malignancies for Lynch syndrome (LS). Universal tumor screening with mismatch repair (MMR) immunohistochemistry (IHC) is now standard practice in these malignancies. Despite this, many patients still fail to complete genetic testing after abnormal MMR results. We reviewed deidentified data from 772 patients with CRC (n=565) and EC (n=207) from the Emory Lynch Syndrome Screening Network (LSSN) database (2013 to 2023). We evaluated age specific cascade performance and COVID-19 era changes. All patients underwent IHC for MLH1, MSH2, MSH6, and PMS2, with reflex BRAF V600E and MLH1 methylation testing performed as indicated. Outcomes included deficient MMR (dMMR) rates, germline testing referral, germline testing completion, and pathogenic variant detection by age (<50 vs ≥50 years) and COVID era (pre-2020 vs ≥2020). Among 119 EOCRC cases, IHC completion was 99% (99/100) with dMMR identified in 15% (15/99). For early-onset EC (n=19), IHC completion was 100% with dMMR in 21% (4/19). For CRC, dMMR rates increased from 12% (59/482) pre-COVID to 51% (41/80) post-COVID. This is likely due to case selection bias post COVID rather than true biologic shifts. EOCRC patients with dMMR had better cascade completion compared to older patients. Referral rates for germline testing were 73% (11/15) in EOCRC vs 17% (14/83) in older patients and germline testing 53% (8/15) in EOCRC vs 11% (9/83) in older patients. Pathogenic variants were detected in 63% (5/8) of tested EOCRC patients vs 44.4% (4/9) of older patients. Post COVID, CRC referrals increased to 36.6% vs 20.3% pre-COVID, but testing completion was largely unchanged (22% vs 17%). Among early-onset EC patients with dMMR, 75% (3/4) completed testing with no pathogenic variants identified. In contrast, older EC patients had 20% (15/74) referral rate and 8% (6/74) completed germline testing with no pathogenic findings. Overall, 84.4% (151 of 179) of dMMR patients across groups never completed germline testing. This is a major implementation gap given the high pathogenic yield among those tested. Systematic interventions are urgently needed to address cascade failures and ensure universal genetic evaluation for all dMMR patients. Citation Format: Gideon T. Dosunmu, Fabienne Ehivet, LePaige R. Godfrey, Hasiya E. Yusuf, Kim Nguyen, Mosunmoluwa Oyenuga, Oluwadunni E. Emiloju, Lindsay Hannan, Patrick S. Sullivan, Christine Stanislaw, Olatunji Alese. Cascade Failure in Lynch Syndrome Diagnosis: A Single-Institution Analysis [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference in Cancer Research: The Rise in Early-Onset Cancers—Knowledge Gaps and Research Opportunities; 2025 Dec 10-13; Montreal, QC, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Clin Cancer Res 2025;31(23_Suppl):Abstract nr A016.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,008 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».