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Enregistrement W4417207561 · doi:10.1158/1557-3265.earlyonsetca25-c012

Abstract C012: Transcriptional profiling of circulating immune cells from patients with early- and late-onset colorectal cancer reveals sex-specific differences

2025· article· en· W4417207561 sur OpenAlexaboutno aff
Timothy J. Kopper, Claire E. Pillsbury, Michael L. Kaufman, Clara Sánchez-Menéndez, María González-Sanmartin, Montserrat Torres, Mayte Coiras, Curtis J. Henry

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSingle-cell and spatial transcriptomics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésImmune systemColorectal cancerCytotoxic T cellPeripheral blood mononuclear cellCytolysisTranscriptomeGeneEffectorGene expression profiling

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Early-onset colorectal cancer (EOCRC), CRC diagnosed before age 50, are rising with the global incidence of EOCRC predicted to double by 2030. Notably, this disease is more common in men and women have better survival outcomes. Changes in immunity with age and between sexes are postulated to contribute to these discrepancies, which warrants further investigation. Therefore, we used single-cell RNA sequencing to analyze peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from males and females with CRC. Our analysis revealed reduced proportions of circulating naïve and effector memory CD8+ T-cells in late-onset colorectal cancer (LOCRC) compared to EOCRC. Similarly, genes associated with proliferation were decreased in circulating CD8+ T-cells from LOCRC patients. Hallmark and GO BP pathway analyses revealed that T-cells isolated from patients with LOCRC have decreased transcriptional profiles associated with AKT/MTOR signaling, lymphocyte differentiation, and cell surface/antigen receptor-mediated signaling. Conversely, upregulated pathways were associated with TNF and interferon alpha signaling, apoptosis, DNA damage, oxidative stress, and RNA/protein homeostasis. Regarding NK cells, in LOCRC, the overall frequency of naïve and cytotoxic populations cells was also decreased while interferon-producing NK cells signatures were increased. Notably, pathway analyses revealed almost identical transcriptional immunosuppressive changes in NK and T-cells in LOCRC. Analysis of sex differences in the immune landscape of EOCRC and LOCRC revealed proliferative defects in CD8+ T-cells in males regardless of age. However, NK cells from males with EOCRC appear to be more functional as highlighted by the increased expression of genes associated with cytolysis and more naïve signatures associated with these cells. Conversely, NK cell signatures in females were robust in both the EOCRC and LOCRC, and did not exhibit age-dependent functional declines. Furthermore, in females, NK cells and T-cells in EOCRC had similar decreases in differentiation, intracellular signaling, decreased TNF activation, and apoptosis signatures but signatures associated with metabolism, protein homeostasis, and p53 activation were increased. Compared to females, pathway analyses of NK cells and T-cells from males with EOCRC revealed reduced gene signatures associated with differentiation and intracellular signaling but enhanced signatures associated with inflammation, oxidative stress, RNA processing, MYC activation, G2M checkpoint activation, and apoptosis. In summary, we reveal that circulating lymphocytes from female patients with EOCRC and LOCRC are more functional than those observed in males. Furthermore, T-cells from males with CRC become more dysfunctional with age, potentially due to increased sensing of pro-inflammatory cytokines like TNF and interferon alpha. Therefore, better survival outcomes for women with CRC may potentially be attributed to possessing a more robust immune system that exhibits minimal decline with aging. Citation Format: Timothy J. Kopper, Claire E. Pillsbury, Michael Kaufman, Clara Sánchez-Menéndez, María González-Sanmartin, Montserrat Torres, Mayte Coiras, Jose Perea Garcia, Curtis J. Henry. Transcriptional profiling of circulating immune cells from patients with early- and late-onset colorectal cancer reveals sex-specific differences [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference in Cancer Research: The Rise in Early-Onset Cancers—Knowledge Gaps and Research Opportunities; 2025 Dec 10-13; Montreal, QC, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Clin Cancer Res 2025;31(23_Suppl):Abstract nr C012.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,307
Score d'incertitude au seuil0,512

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,073
Tête enseignante GPT0,373
Écart entre enseignants0,300 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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