Evaluation of an HPV16-L1 antibody rapid test for oropharyngeal cancer diagnosis: diagnostic accuracy and challenges in real-world settings
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Diagnostic assays have been introduced to diagnose human papillomavirus (HPV)-driven oropharyngeal cancer (HPV-OPC), including those identifying HPV16-L1 antibodies. This study aims to evaluate the diagnostic accuracy of an HPV16-L1 antibody rapid test for HPV-OPC, and its performance in individuals likely to have HPV16-L1 antibodies from causes other than HPV-OPC. METHODS: Serum samples (n = 235) from three study populations were tested using a CE-certified serological HPV16-L1 antibody rapid test (Prevo-Check®) at the German National Reference Center for Papillomaviruses. Laboratory personnel were blinded to participant characteristics and followed the manufacturer's instructions. The three study populations consisted of: (1) patients with HPV16-positive or -negative OPC (n = 83), (2) bivalent (HPV16/18) vaccine recipients (n = 50), with paired baseline and one-month post-third-dose serum samples, and (3) naturally HPV16 infected young adults (n = 26), with paired serum samples before and after HPV16 seroconversion. FINDINGS: In the study population with patients with OPC, the sensitivity of the HPV16-L1 antibody rapid test to detect HPV-OPC was 25.0% (95% CI: 13.6, 39.6), and its specificity was 97.1% (95% CI: 85.1, 99.9). The positive predictive value was 92.3% (95% CI: 64.0, 99.8) and negative predictive value 48.6% (95% CI: 36.4, 60.8). In the other study populations, the test was negative for all pre-vaccination samples, and all samples collected before incident natural HPV16 infection. Nearly all post-vaccination samples (98.0%), and one-third of the samples after natural HPV16 infection (34.6%) tested positive in the HPV16-L1 antibody rapid test. INTERPRETATION: The HPV16-L1 antibody test has low diagnostic accuracy and cannot reliably distinguish different sources of HPV16-L1 antibodies. Therefore, this type of assays is not suitable for screening and detection of HPV16-driven OPC. FUNDING: This study is supported by the Ministry of Research, Technology and Space (BMFTR) core bvfunding provided to DKFZ. The NRC for Papilloma- and Polyomaviruses is supported by the Ministry of Health (BMG, grant no. 1369-401).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,028 | 0,051 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».