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Enregistrement W4417258559 · doi:10.64898/2025.12.10.25341951

A distinct serum metabolic signature outperforms C-reactive protein as a non-invasive marker for monitoring disease activity in Inflammatory Bowel Disease

2025· preprint· W4417258559 sur OpenAlexaff
Lina Welz, Björn‐Hergen Laabs, Danielle M M Harris, Sven Schuchardt, Florian Tran, Silvio Waschina, Norbert Frey, André Franke, Bram Verstockt, Séverine Vermeire, Philip Rosenstiel, Stefan Schreiber, Konrad Aden

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2025
Typepreprint
Langue
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensGovernment of Nova Scotia
Organismes subventionnairesElse Kröner-Fresenius-StiftungDeutsche ForschungsgemeinschaftEuropean Commission
Mots-clésMetabolomicsInflammatory bowel diseaseDiseaseMetabolomeBile acidUlcerative colitisBiomarker

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Achieving deep remission, such as e.g. histo-endoscopic remission, is a key objective in inflammatory bowel disease (IBD). However, this metric depends on invasive procedures that are impractical in routine care, whereas current non-invasive blood biomarkers demonstrate only limited correlation with disease activity. Objective We used serum metabolomics to identify blood-based signatures that comprehensively assess disease activity. Design Serum was collected from HC (n=195), UC (n=183; Kiel, discovery), UC (n=52; Leuven, validation) and CD (n=98; Kiel) cohorts alongside composite assessment of disease activity using endoscopic, clinical, biochemical, and histopathological criteria. Targeted metabolomics was performed with the Biocrates MxP Quant 500(XL) kit. Statistical analysis involved principal component analysis (PCA), linear mixed models (LMM), generalised estimating equation (GEE) and ML (logistic, LASSO regression). Results We identified numerous serum metabolites predominantly related to amino acid, bile acid and lipid metabolism that differed significantly between HC and inactive or active UC/CD. Among those, increased beta-alanine and Hex2Cer(d18:1/16:0) accompanied by diminished tryptophan and histidine distinguished active from inactive UC as well as HC from active IBD across several disease activity definitions. Combining those metabolites better estimated disease activity than C-reactive protein (CRP). Lastly, prior to initiation of advanced therapy, baseline metabolites and LASSO-selected combinations thereof exhibited limited ability to predict remission. Conclusion Serum metabolomics distinguished IBD from HC and inactive from active disease, with a four-metabolite panel outperforming CRP in comprehensively assessing disease activity. Despite restricted predictive performance, our findings underscore the value of serum metabolomics in elucidating IBD pathophysiology and improving disease monitoring. What is already known on this topic Serum metabolomics reveal systemic immunometabolic alterations in IBD, but prior studies lack composite disease activity measures and independent validation. What this study adds Cross-cohort analysis of comprehensively assessed disease activity revealed metabolic signatures that distinguish IBD from HC and inactive from active disease states, with superior discriminatory power compared to CRP. However, baseline metabolites exhibit limited ability to predict outcomes. How this study might affect research, practice or policy Our findings highlight both the potential and current constraints of serum metabolomics for clinical application, emphasizing the need for standardized, longitudinal, and multi-cohort studies to enable reproducible biomarker discovery in IBD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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