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Enregistrement W4417258875 · doi:10.64898/2025.12.08.25341873

Evaluation of the performance and feasibility of RLDT in detecting <i>Shigella</i> in a primary healthcare facility of rural Bangladesh

2025· preprint· en· W4417258875 sur OpenAlexfundno aff
Sampa Dash, Eva Sultana, Farina Naz, Muntasirur Rahman, Md. Motiar Rohman, Tahmeed Ahmed, Abu Syed Golam Faruque, Subhra Chakraborty

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesInternational Centre for Diarrhoeal Disease Research, BangladeshNational Institutes of HealthMcGill University Health Centre
Mots-clésShigellosisDiarrheaPrimary health careHealth careTest (biology)DysenteryPrimary careHealth facility

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Shigellosis remains underdiagnosed due to the lack of rapid, reliable diagnostics. Although Shigella spp. is known for causing dysentery, over 50% of Shigella -associated cases are watery diarrhea. Identifying and treating these cases of watery diarrhea caused by Shigella could be lifesaving, which would require a point-of-care (POC) Shigella test. Evidence-based treatment could also reduce the overuse of antibiotics. We evaluated the feasibility and applicability of the Rapid LAMP-based Diagnostic Test (RLDT) assay for detecting shigellosis in a healthcare facility. Stool samples (n=228) were collected from children seeking facility care during diarrhea and on their follow-up visits from an ongoing case-control study, INSIGHT. The stool samples were tested by the INSIGHT lab personnel using the RLDT for Shigella spp. The lab personnel at a rural primary healthcare facility, Mirzapur Upazila Health Complex (MUHC) in Bangladesh, received training in RLDT and retested the stool samples with RLDT at the MUHC; the results were compared. The acceptance of RLDT at MUHC was also evaluated through questionnaires. After training, the MUHC lab personnel independently performed RLDT. The RLDT tests performed by the MUHC showed sensitivity of 98% and specificity of 99%, with an almost perfect agreement (Kappa = 0.96) compared with the pre-tested RLDT results. The RLDT assay was well received by the MUHC, despite the general challenges of limited manpower and resources at rural health care facilities. This study demonstrates the potential of using RLDT as a POC test in Shigella -endemic countries to support evidence-based treatment, saving lives and reducing inappropriate antibiotic use. Keypoints RLDT, as a simple and accurate diagnostic tool, offers a practical solution for Shigella detection in low-resource settings. Scaling up RLDT will empower health systems by enabling timely diagnoses to guide treatment and reduce antimicrobial resistance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,042

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,337
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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