Odd-skipped family members have conserved roles in segmentation, appendage, excretory system and gut development in bilaterian animals
Notice bibliographique
Résumé
The odd-skipped related family of proteins are evolutionarily conserved zinc finger transcription factors in bilaterian animals with essential roles in body segmentation, as well as gut, excretory system and appendage development. Although they are prognostic biomarkers in several cancers, their molecular function is poorly understood. To gain a deeper understanding of how this family of transcription factors is implicated in human disorders and cancer, we explore the functions of Odd-skipped related transcription factors as well as their invertebrate homologs during development. We found that vertebrate Osr1 binds to DNA targets within the WNT, BMP, HH, TGFβ, Notch and retinoic acid signaling pathways, suggesting that Osr genes coordinate and integrate multiple pathways during development, potentially by binding to heterochromatin as pioneer transcription factors. From a protein tree analysis of odd-skipped family orthologs and paralogs, it appears that vertebrate, nematode, and insect paralogues have arisen via independent gene duplication events, and that their common ancestor likely had a single odd-family gene. We hypothesize that the ancestral odd-family protein was required for gut and gut-derived structures and was subsequently co-opted to perform additional functions in other tissues as part of the evolution of organisms. These observations posit new uncharacterized functions for Osr genes in the development of bilaterian animals and in cancer models.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».