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Enregistrement W4417266188 · doi:10.1016/j.xplc.2025.101673

Three transcription factors, OsNF-YC8, OsNF-YC9, and OsNF-YC10, function redundantly to promote amylopectin synthesis by activating SBE3 expression in rice endosperm

2025· article· en· W4417266188 sur OpenAlexaff
Jiabin Chen, Xinyue Bian, Rui Chu, Tao Wang, Rui Yang, Changquan Zhang, Li‐Chun Huang, Xiaolei Fan, Qiaoquan Liu

Notice bibliographique

RevuePlant Communications · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueFood composition and properties
Établissements canadiensMinistry of Agriculture
Organismes subventionnairesNational Key Research and Development Program of ChinaQinglan Project of Jiangsu Province of ChinaGovernment of Jiangsu ProvincePriority Academic Program Development of Jiangsu Higher Education InstitutionsKey Technologies Research and Development ProgramNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésEndospermAmylopectinStarchMutantGeneEnzymeTranscription factorGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Starch branching enzyme (SBE) is a key enzyme in starch biosynthesis that introduces branch points into starch molecules. Among its three isoforms, SBE3 plays a pivotal role, as its loss of function significantly alters starch granule structure and accumulation in rice, leading to chalky grains and reduced grain weight. However, the molecular regulatory network governing SBE3 expression remains largely unknown. In this study, three NF-YC family transcription factors-OsNF-YC8, OsNF-YC9, and OsNF-YC10-were identified as transcriptional activators of SBE3, each directly binding to the AAGAGG motif in the SBE3 promoter. Functional analysis revealed functional redundancy among these NF-YC members, as disruption of one or two genes had little effect on SBE3 expression. In contrast, simultaneous disruption of all three genes in the osnf-yc8/9/10 triple mutant resulted in a pronounced reduction in SBE3 transcription, accompanied by a substantial decrease in short-chain amylopectin with degrees of polymerization ranging from 6 to 24. The endosperm of osnf-yc8/9/10 appeared milky white, and resistant starch content was 3.7-fold higher than that of the wild type, without a significant reduction in grain weight. These results elucidate the regulatory roles of OsNF-YC8, OsNF-YC9, and OsNF-YC10 in SBE3 expression and short-chain amylopectin biosynthesis, highlighting their potential for developing functional rice cultivars.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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