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Enregistrement W4417290133 · doi:10.1038/s41467-025-67153-1

Sequestration of the phagocyte metabolite itaconate by Pseudomonas aeruginosa RpoN promotes successful pulmonary infection

2025· article· en· W4417290133 sur OpenAlexafffund
Zihua Liu, Ying-Tsun Chen, Absar Talat, Griffin Gowdy, Joseph E. Miller, Lindsey C. Florek, Lars E. P. Dietrich, Chu Wang, Ian A. Lewis, Tania Wong Fok Lung, Sebastián A. Riquelme, Alice Prince

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteWeill Cornell Medical CollegeInternational Microbiome Centre, University of CalgaryNational Institutes of HealthCanterbury Medical Research Foundation
Mots-clésrpoNPseudomonas aeruginosaSigma factorCysteineBacteriaCatabolismTranscription factorMetabolite

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Inhaled opportunistic pathogens such as Pseudomonas aeruginosa actively modify gene expression to meet the challenges of a new environment. In the infected airway the bacteria must respond to the immunometabolite itaconate, which is abundantly produced by macrophages and has anti-inflammatory and anti-oxidant functions that protect the host from airway damage and causes toxicity to bacteria. As a dicarboxylate that targets cysteine residues, itaconate can modify both bacterial and host proteins often altering metabolic activity. We demonstrate that itaconate promotes a global metabolic response in P. aeruginosa by enhancing the activity of the major alternative transcription factor RpoN. Itaconate is actively transported into the bacteria, induces σ54 rpoN expression and covalently binds cysteine residues 218 and 275 on RpoN helping to neutralize its toxicity. The S-itaconated RpoN exhibits a gain of function driving increased glucose catabolism and enhanced utilization of the bioenergetically efficient Entner–Doudoroff pathway. Thus, the accumulation of itaconate in the infected airway promotes the adaptation of P. aeruginosa to the lung by optimizing its metabolic activity and ability to cause pneumonia. Itaconate is an airway metabolite released by phagocytes in response to infection. Here, the authors show that itaconate acts as a signal to simulate the adaptation of Pseudomonas aeruginosa to the lung by modifying RpoN through S-itaconation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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