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Enregistrement W4417291129 · doi:10.64898/2025.12.11.25341975

DE NOVO VARIANTS IN THE POLY(RC)-BINDING PROTEIN GENE <i>PCBP1</i> CAUSE A NEURODEVELOPMENTAL DISORDER

2025· preprint· en· W4417291129 sur OpenAlexaff
Wallid Deb, Thomas Besnard, Florence Desprez, Benjamin Cogné, Laura Do Souto Ferreira, Virginie Vignard, Sylviane Marouillat, Louis Januel, Svetlana Gorokhova, Tiffany Busa, Victor Morel, Benjamin Dauriat, Vincent Desportes, Anne Slavotinek, Yu An, Hane Lee, Jessy Hary, Peter Kannu, Taryn Athey, Ingrid M.B.H. van de Laar, Marjon A. van Slegtenhorst, Patricia Dickson, Alison M. Muir, Rebecca Buchert, Tobias B. Haack, Dominic Imort, Sérgio B. Sousa, Belinda Campos‐Xavier, Pedro M Almeida, Mihael Rogač, Borut Peterlin, Sophie Kaspar, Christian Netzer, Hans Zempel, Meghan C. Towne, Roger L. Ladda, Susan L. Sell, Paweł Gawliński, Xiaofei Song, Wojciech Wiszniewski, Daniel G. Calame, Jennifer E. Posey, Frédéric Ebstein, James R. Lupski, Bertrand Isidor, Stéphane Bezieau, Frédéric Laumonnier, Sébastien Küry

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthInternational Rett Syndrome FoundationInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleAgence Nationale de la RechercheMuscular Dystrophy AssociationEuropean Commission
Mots-clésRNA splicingExonGeneAlternative splicingNeurodevelopmental disorderTranscriptomeRNA-binding proteinNeurogenesis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Poly(rC)-binding protein 1 (PCBP1), a splicing factor and key member of the hnRNP E family, was initially characterized for its tumor suppressive properties. More recently, its role in regulating gene expression in the brain and nervous system has attracted growing interest. Through an international multicenter collaboration, we identified 13 de novo pathogenic variants in PCBP1 across 13 unrelated families. All affected individuals exhibited intellectual disability (ID), with autism spectrum disorder (ASD) as a prominent feature. Functional analysis in primary hippocampal mouse neuron cultures demonstrated that PCBP1 variants impair dendritic arborization, underscoring their deleterious effects. Transcriptomic profiling by RNA sequencing of subjects-derived T cells showed a distinctive signature characterized by significantly increased exon skipping. These results highlight the essential role of PCBP1 in neurogenesis and neuritogenesis, revealing the impact of loss-of-function variants in cells harboring PCBP1 pathogenic variants, thereby confirming the link between splicing defects and neurodevelopmental disorders. Collectively, our findings demonstrate the critical role of PCBP1 in neurodevelopment, reaffirming the importance of splicing regulation in mammalian neurodevelopment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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