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Enregistrement W4417327857 · doi:10.1038/s41467-025-66037-8

Biomimetic fractal topography enhances podocyte maturation in vitro

2025· article· en· W4417327857 sur OpenAlexafffund
Chuan Liu, Praful Aggarwal, Karl T. Wagner, Shira Landau, Teng Cui, Xin Song, Laleh Shamaei, Naimeh Rafatian, Yimu Zhao, Sonia Rodríguez‐Ramírez, Keith Morton, Elizabeth Virlee, Chen Yu Li, Dawn Bannerman, Simon Pascual‐Gil, Sargol Okhovatian, Anastasia Radisic, Sergi Clotet‐Freixas, Teodor Veres, Mohtada Sadrzadeh, Tobin Filleter, Ulrich Broeckel, Ana Konvalinka, Milica Radisic

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal Diseases and Glomerulopathies
Établissements canadiensHeart and Stroke FoundationSt. Joseph’s Healthcare HamiltonSystems, Applications & Products in Data Processing (Canada)Structural Genomics ConsortiumUniversity of AlbertaToronto General HospitalUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchKillam TrustsNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGovernment of CanadaAdditional Ventures
Mots-clésFractalFractal dimensionGlomerulusCellIn vivoCell growthIn vitroPhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In their native environment, tissues are organized into intricate fractal structures, rarely recapitulated in their culture in vitro. The extent to which fractal (self-similar) patterns that resemble complex topography in vivo influence cell maturation remain inadequately elucidated. Yet, the application of fractal topographical stimulation may address the challenge of improving the differentiated cell phenotype in vitro. Here, we show fractality in the kidney glomerulus and podocytes, branching highly differentiated cells within the glomerulus. Biomimetic fractal patterns derived from glomerular histology are used to generate topographical (2.5-D) substrates for cell culture. Podocytes grown on fractal topography exhibit higher expression of functional markers and enhanced cell polarity. RNA sequencing suggests podocytes’ enhanced ECM deposition and remodeling on fractal versus flat topography, and enhanced maturation accompanied by stress on fractal versus non-fractal topography. The incorporation of fractal topography into standard well plates may serve as a user-friendly bioengineered platform for high-fidelity cell culture. Liu and colleagues demonstrate that biomimetic fractal patterns derived from glomerular histology can enhance the maturation of podocytes (highly differentiated glomerular cells) that are grown in culture. This work presents a bioengineered platform for improved cell culture fidelity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,320
Écart entre enseignants0,310 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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