Inferring the strength of directional selection on armor plates in Lake Washington stickleback while accounting for migration and drift
Notice bibliographique
Résumé
Contemporary evolution allows us to investigate how natural selection drives phenotypic and genotypic evolution in nature. Recent advances in molecular genetics have identified causative genes underlying adaptive traits, enabling estimation of selection coefficients at these loci. However, estimating selection is challenging when populations receive migrants from genetically and phenotypically distinct populations. With genome-wide data now allowing estimation of migration rates and effective population sizes, these demographic parameters can be integrated into models for measuring selection. In Lake Washington, USA, the frequency of the completely plated morph of the threespine stickleback (Gasterosteus aculeatus) increased from 1957 to 2005, plausibly due to increased trout predation pressure caused by enhanced water clarity. Here, we estimated the selection coefficient at a major locus responsible for the plate morph using historical data, taking migration and genetic drift into consideration. Model-based predictions of present allele frequencies were tested with samples collected in 2022. Consistent with directional selection, the completely plated morphs and the underlying allele have increased since 2005, but to higher frequencies than predicted, suggesting a recent increase in selection. Thus, integrating molecular genetics, population genomics, and simulations enables the estimation of selection strength while considering migration and drift, to reveal directional selection in nature.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».