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Enregistrement W4417421095 · doi:10.64898/2025.12.16.694710

Metabolic, epigenetic and transcriptomic alterations in postnatal 16p11.2-deficient murine astrocytes

2025· article· W4417421095 sur OpenAlexafffund
Nicole Blakeley, Shama Naz, Ziying Liu, Tyler M. Renner, Sonia Leclerc, César H. Comin, Matheus Viana da Silva, Caroline Vergette, Christopher J. Porter, Theodore J. Perkins, Baptiste Lacoste

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typearticle
Langue
DomaineNeuroscience
ThématiqueAutism Spectrum Disorder Research
Établissements canadiensUniversity of OttawaOttawa Hospital
Organismes subventionnairesCongressionally Directed Medical Research ProgramsOttawa Hospital Research InstituteCanadian Institutes of Health ResearchTerry Fox FoundationUniversity of OttawaU.S. Department of Defense
Mots-clésEpigeneticsTranscriptomePhenotypeGeneAstrocyteGene expressionDNA methylationGene expression profilingEpigenesis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SUMMARY Autism Spectrum Disorders (ASD) are associated with metabolic dysregulation. While astrocytes are integral to cerebral metabolism, their molecular and functional changes in ASD are poorly known. Using early postnatal primary cortical astrocytes from a mouse model of 16p11.2 deletion ASD syndrome ( 16p11.2 df/+ mice), we observed core molecular alterations with sex-specific profiles, suggesting divergent energetic pathways and epigenetic regulation. Targeted metabolomics revealed opposing phenotypes in male versus female 16p11.2 df/+ astrocytes, particularly for alpha-ketoglutaric acid. Functionally, 16p11.2 df/+ astrocytes exhibited elevated phosphorylation in low glucose culture conditions, and reduced glycolysis in high glucose. Epigenetic profiling of male 16p11.2 df/+ astrocytes revealed differentially hydroxymethylated and methylated regions, with foci on chromosomes 3 and 13. Finally, bulk RNA sequencing in male and female mutant astrocytes indicated differential gene expression with profound sex differences, mostly affecting pathways related to cellular morphology. By establishing 16p11.2 df/+ astroglial molecular signatures, this study refines our understanding of glial changes in ASD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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