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Enregistrement W4417448923 · doi:10.1093/qjmed/hcaf326

Whole genome sequencing confirms reactivation of tuberculosis five years after initial infection despite adequate preventative therapy in a patient with profound immunosuppression

2025· article· en· W4417448923 sur OpenAlexaff
E McNally, Margaret Fitzgibbon, Emma Roycroft, Lorraine Dolan, Catherine Flynn, Joseph Keane, Anne-Marie McLaughlin

Notice bibliographique

RevueQJM · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensTrinity College
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésImmunosuppressionWhole genome sequencingTuberculosisEpidemiologyDNA sequencingVigilance (psychology)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Tuberculosis infection (TBI) can persist for years, with reactivation risk markedly increased by profound immunosuppression. Whole-genome sequencing (WGS) can definitively distinguish reactivation from reinfection, offering critical epidemiological and clinical insights. We report a patient with prior household exposure to pan-sensitive pulmonary tuberculosis who completed nine months of isoniazid prophylaxis after a positive Mantoux test. Five years later, the patient underwent matched unrelated donor allogeneic hematopoietic stem cell transplantation for refractory paroxysmal nocturnal hemoglobinuria, followed by intensive immunosuppression including high-dose corticosteroids, tacrolimus, ruxolitinib and vedolizumab for severe gastrointestinal graft-versus-host disease. Six months post-transplant, the patient developed persistent fevers. Imaging revealed progressive mediastinal and hilar lymphadenopathy. Bronchoalveolar lavage and blood cultures confirmed disseminated Mtb infection. WGS confirmed near identical isolates between the patient and their previous infectious tuberculosis disease household contact, confirming progression of 5 years prior TBI rather than reinfection. This case demonstrates that Mtb can persist for years despite adequate prophylaxis, with reactivation triggered by a synergistic immunosuppressive milieu that disrupts Th1 immunity, macrophage function, and granuloma integrity. WGS provided definitive confirmation of reactivation after 5 years, highlighting its public health value in complex clinical scenarios. TBI can reactivate under profound immunosuppression even after prior prophylaxis. Clinicians should maintain vigilance for reactivation in high-risk patients, and WGS should be performed to guide diagnosis, treatment, and epidemiological understanding.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,711
Score d'incertitude au seuil0,371

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,336
Écart entre enseignants0,313 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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