The genetic architecture of Parkinson’s disease on the Island of Crete
Notice bibliographique
Résumé
We investigated the genetic landscape of Parkinson's disease (PD) on the island of Crete. DNA samples from 360 PD patients and 251 controls were analyzed using a combination of genotyping, whole-exome sequencing, and targeted screening for GBA1 variants p.N409S and p.L483P. A molecular diagnosis (heterozygous dominant/homozygous recessive pathogenic/likely pathogenic non-GBA1 variant) was identified in 3.1% of patients, including LRRK2-PD (n = 4) and SNCA-PD (n = 1). A novel homozygous PINK1 variant (p.Y295Ter) and a rare homozygous FIG4 variant (p.I41T) were detected in two early-onset cases. About 10.3% of patients carried a GBA1 variant, including four rare variants (p.C55S, p.H294Q, p.K237T, p.R502H), and had an adjusted earlier disease onset of 7.3 years. GBA1 carriers had a 4.3-fold higher risk for PD compared to non-carriers. The proportion of GBA1 in Crete is substantially higher than on the Greek mainland, highlighting the distinct genetic PD profile in this population and supporting targeted genetic testing and counseling.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».