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Enregistrement W4417462947 · doi:10.1099/ijsem.0.007009

Proposal of Furfurilactobacillus cerevisiae sp. nov. isolated from spoiled beer and Furfurilactobacillus cerealis sp. nov. isolated from sourdough

2025· article· en· W4417462947 sur OpenAlexafffund
Dor Zipori, Nanzhen Qiao, Merlin Brychcy, Michael G. Gänzle, Herbert Schmidt

Notice bibliographique

RevueINTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Phylogenetic Studies
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesForschungskreis der ErnährungsindustrieCanada Research Chairs
Mots-clésGenePhylogenetic treeGenomeBacteriaStrain (injury)Adaptation (eye)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A core genome phylogenomic analysis of two lactic acid bacteria isolates from spoiled beer, Furfurilactobacillus sp. LTH 5742 and LTH 5750, one isolate from sourdough, Furfurilactobacillus sp. C5, and the type strains of five Furfurilactobacillus species were performed. Average nucleotide identity and digital DNA–DNA hybridization analyses revealed two distinct phylogenetic lineages, both clearly separated from the five previously described Furfurilactobacillus species. Based on these data, two novel species were proposed: Furfurilactobacillus cerevisiae sp. nov., represented by strains LTH 5742 T (=DSM 120514 T =LMG 34151 T ) and LTH 5750, and Furfurilactobacillus cerealis sp. nov., represented by strain C5 T (=DSM 120515 T =LMG 34152 T ). Comparative genomic analyses highlighted distinct metabolic signatures concerning the 1,2-propanediol and hydroxycinnamic acid metabolism. The gene aldA encoding lactaldehyde dehydrogenase, contributing to 1,2-propanediol production from lactate, is present in Ff . spp. LTH 5742 T and LTH 5750, Ff . spp. C5 T and Furfurilactobacillus rossiae but not in Furfurilactobacillus milii . Genes for 1,2-propanediol conversion to propionate and propanol are present in Ff. rossiae but not in one of the other species. The glutathione reductase gene, gshR , was uniquely detected in Ff. cerealis , Ff. rossiae and ‘ Furfurilactobacillus entadae’ . These findings expand the diversity of the genus Furfurilactobacillus and provide insight into their ecological adaptation in cereal-based fermentations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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