Frequency of alleles linked to Cry1F resistance in European corn borer (Lepidoptera: Crambidae) from the United States
Notice bibliographique
Résumé
Corn genetically engineered to produce insecticidal proteins from Bacillus thuringiensis Berliner (Bacillales: Bacillaceae) (ie Bt corn) has toxicity against specific insect pests. However, field-evolved resistance to Bt crops has emerged in several species, including the European corn borer (ECB, Ostrinia nubilalis Hübner). The first case of practical resistance in ECB to Bt corn producing the Cry1F insecticidal protein was documented in 2018 in Nova Scotia, Canada. Six mutations in an ABC transporter gene (OnABCC2) were associated with this resistance; five of these caused nonsynonymous amino acid changes and one causes a two base pair deletion (TA12076-) resulting in a frameshift and premature stop codon. We genotyped 364 ECB individuals collected between 2022 and 2023 across the USA at these six loci and complemented the analysis with targeted OnABCC2 exome sequencing and ECB strain association analysis. Allele frequencies significantly varied across markers and locations. The TA12076- allele was detected in 2023 at a low frequency (0.01) across all sites. Targeted OnABCC2 exome sequencing identified 130 alleles, 41 of them which cause nonsynonymous changes, but no additional indels. Strain genotyping matched previously known ECB strain distributions but showed no association with Bt resistance Our data indicated that the TA12076- allele occurred at low frequency in U.S. populations, consistent with the absence of reported Cry1F field failures, as resistance is recessive. This indel was detected in heterozygous individuals from 3 populations (New Hampshire, Ohio, and Iowa). These observations underscore the importance of efforts monitoring for Bt resistance evolution and spread in ECB populations.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».