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Enregistrement W4417499830 · doi:10.1186/s13148-025-02021-9

The role of placental DNA methylation in the pathogenesis of chronic intervillositis of unknown etiology

2025· article· en· W4417499830 sur OpenAlex
Amy M. Inkster, Maria S. Peñaherrera, Wendy P. Robinson, Jefferson Terry

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueClinical Epigenetics · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePregnancy and preeclampsia studies
Établissements canadiensChildren's & Women's Health Centre of British ColumbiaUniversity of British Columbia HospitalBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchBC Children's Hospital
Mots-clésPathogenesisHuman geneticsEtiologyDNA methylationInfiltration (HVAC)PlacentaPregnancy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: Chronic intervillositis of unknown etiology (CIUE) is the pathological influx of maternal inflammatory cells into the intervillous space of the placenta without demonstrable cause. CIUE is associated with placental damage and increased risk of pregnancy loss, fetal demise, and growth restriction. The pathogenic mechanism is unclear, and we lack biomarkers for detection, and treatments to prevent recurrence. DNA methylation (DNAme) is a biomarker altered in association with many disease states. We hypothesized that CIUE may be associated with a distinct signature placental DNAme signature. METHODS: DNAme was profiled using the Illumina Infinium MethylationEPIC v2.0 array on fresh-frozen placental tissue. After quality control, data were available for 24 CIUE (14 high grade, 10 low grade) and 27 non-CIUE placental samples, plus six independent decidua samples. CIUE was confirmed and graded by a perinatal pathologist. Contamination was assessed using the 65 array genotyping probes, placental cell composition and epigenetic age were estimated. After processing, DNAme data were available at 855,732 CpGs. RESULTS: Several lines of evidence indicated maternal DNA in CIUE placentas. Genetic contamination metrics were higher in CIUE than non-CIUE cases. In XY samples, X chromosome copy number increased with CIUE grade, suggesting XX contaminating DNA. Principal components analysis placed CIUE samples closer to decidua along PC1 than non-CIUE samples, cell composition showed elevated Hofbauer cells, monocytes, and neutrophils in CIUE. Epigenetic age was higher in CIUE versus non-CIUE samples. Together, these findings suggested an increased concentration of non-self XX DNA in CIUE cases, likely originating from an adult, macrophage-rich source, suggesting a maternal origin. An epigenome-wide association study found that all significant differentially methylated loci associated with CIUE were attenuated after adjusting for cell composition. CONCLUSIONS: Our results illustrate that placental DNAme patterns in CIUE reflect signatures of maternal infiltration rather than intrinsic DNAme alterations. This study also highlights the value of integrating the diverse molecular data outputs of DNAme arrays to explore the presence of maternal cells in placental tissue.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,380
Score d'incertitude au seuil0,178

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,359
Écart entre enseignants0,332 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle