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Enregistrement W45428076 · doi:10.1096/fasebj.24.1_supplement.612.14

ATF3 is activated in ventilator induced lung injury

2010· article· en· W45428076 sur OpenAlexaff
Claúdia C. dos Santos, Ali Akram, Hussain Masoom, Bing Han, Jack J. Haitsma, Claudia Peng, Yuexin Shan, Haibo Zhang, Mingyao Liu, Tsonwin Hai, Arthur S. Slutsky

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeonatal Respiratory Health Research
Établissements canadiensSt. Michael's HospitalMuscular Dystrophy CanadaUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésATF3Western blotIn vivoMicroarray analysis techniquesMicroarrayMolecular biologyBiologyChemistryGene expressionCell biologyGenePromoterBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction Mechanical ventilation (MV) has been shown to cause ventilator‐induced lung injury (VILI). We wanted to identify novel molecular targets involved in reducing the harmful effects of MV (VILI). Methods To identify potential novel genes and proteins involved in VILI we i) performed microarray analysis on previously published VILI animal model data, ii) exposed human bronchial epithelial cells (Beas‐2b) in vitro to mechanical cyclic stretch (30 cycles/min for 4 hours), iii) performed western blot analysis on these stretched and non‐stretched cells, and iv) validated the regulation of the newly discovered gene(s) in vivo using wild type (WT) and ATF3 (Activator transcription factor 3) knock‐out mice (ATF3 KO). These two groups of mice were exposed to either injurious or non‐injurious ventilation strategies in combination with LPS or saline. Results ATF3 was identified by microarray analysis as one of the main genes involved in VILI. The presence of this factor was validated in vitro in the mechanically cyclic‐stretched Beas‐2b cells. Western blot assays confirmed expression of ATF3 in the stretched cells and their absence in the static cells. We further confirmed the regulation of ATF3 using WT and ATF3 KO mice in a model of VILI in vivo . ATF3 KO mice exposed to LPS in combination with injurious MV had more inflammation than WT mice of similar treatment or mice treated with saline. Conclusion Expression of ATF3 is stretch dependent and this gene seems to confer protection in combination with MV. Specific targeting of this factor in clinical settings could reduce VILI in patients receiving MV.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,388
Écart entre enseignants0,343 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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