A simple and fast method for the enrichment of lymphoid progenitors from mouse bone marrow (153.9)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The expression of IL-7Rα in the common lymphoid progenitor (CLP) population marks initiation and/or commitment to the lymphoid lineage. CLPs hold potential for only B, T and NK cell lymphoid lineages and are defined as Lin−IL-7Rα+c-KitloSca-1lo. Study of lymphocyte development largely relies on access to CLPs or other IL-7Rα+ lymphoid progenitors. Fluorescence-activated cell sorting (FACS) commonly used to isolate lymphoid progenitors is costly, time-consuming and possibly detrimental to cell viability. We describe a fast and efficient method for the isolation of lymphoid progenitors from mouse bone marrow (BM). This method is based on immunomagnetic, column-free cell separation technology (EasySepTM). Using this method, lineage positive cells are first depleted by cross-linking them to magnetic particles using biotinylated antibodies. Next, IL-7Rα+ cells are positively selected from the Lin−/lo population. After enrichment, average purity of Lin−IL-7Rα+ lymphoid progenitors as assessed by flow cytometry is 32 ± 10% (n=18). Lin−IL-7Rα+c-KitloSca-1lo cells are enriched 60-fold from 0.08 ± 0.05% in start BM to 4.6 ± 2.5%. Limiting dilution analysis of enriched cells shows increased frequencies of B cell (1:73, n=12), T cell (1:16, n=5) and NK cell (1:65, n=6) progenitors as compared to non-depleted control BM. This system introduces an easy method for the enrichment of lymphoid progenitors with good viability that will enable study of developmental immunology.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,009 | 0,012 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».