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Enregistrement W49308213 · doi:10.4049/jimmunol.178.supp.47.32

Are Broadly Neutralizing Antibodies against HIV-1 Unusual? (47.32)

2007· article· en· W49308213 sur OpenAlexaff
Jamie K. Scott, X. Wang, Shanyun Wu, Christa Lepik, Harpal Singh, D. D. Richman, Paul J. Utz, Felix Breden

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpitopeMonoclonal antibodyAntibodyAntigenHuman immunodeficiency virus (HIV)ImmunologyVirologyMonoclonalBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract To date, AIDS vaccines cannot induce broadly(b)-neutralizing (Nt) antibodies (Abs) against HIV-1. It has been suggested that HIV’s Nt epitopes mimic “self” epitopes, and that bNt Abs are rare because they develop from autoreactive B cell clones that are normally deleted or made anergic by self antigens (Agns); such Abs are thought to have long CDR-H3 loops (H3s). Thus, self-tolerance must be broken to accumulate self-reactive naïve B cells whose Abs recognize Nt, HIV-1 epitopes. It has been reported that most of the bNt monoclonal (M)Abs have very long H3s, and that most react with self molecules (e.g., cardiolipin, CL). Alternatively, bNt Abs may arise out of “normal” Ab responses, with HIV Agns selecting bNt Abs with long H3s, and/or long H3s may develop via processes driven by persistent Agn. We have begun to test these models by several approaches. Using autoAgn ELISAs and microarrays, bNt MAbs were shown not to be unusually self-reactive, compared to genuine autoreactive MAbs or autoimmune sera; also, bNt sera did not react significantly with CL. Finally, sequence analysis of ~700 human MAbs indicated that the bNt MAbs are no different than non-Nt MAbs against HIV-1 or other chronic viruses, or autoimmune anti-protein MAbs; but they are very different from autoimmune MAbs against non-protein autoAgns. Taken together, our results support the conclusion that HIV-bNt Abs are not unusual in their reactivity or structures.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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