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Enregistrement W50275070 · doi:10.1155/2011/276017

Antimicrobial Resistance Surveillance Systems: Are Potential Biases Taken into Account?

2011· article· en· W50275070 sur OpenAlexaff
Olivia Rempel, Johann Pitout, Kevin B. Laupland

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Infectious Diseases and Medical Microbiology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntibiotic Use and Resistance
Établissements canadiensCalgary Laboratory ServicesAlberta Health ServicesHealth Sciences CentreUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSampling biasMedicineSampling (signal processing)StatisticsMEDLINESelection biasData collectionSample size determinationComputer scienceMathematicsPathologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The objective of this study was to assess potential biases that may influence the validity of contemporary antimicrobial‐resistant (AMR) pathogen surveillance systems. Although surveillance data have been widely published and used by researchers and decision makers, little attention has been devoted to the assessment of their validity. A Medline search was used to identify reports, in 2008, of laboratory‐based AMR surveillance systems. Identified surveillance systems were appraised for six different types of bias. Scores were assigned as ‘2’ (good), ‘1’ (fair) and ‘0’ (poor) for each bias. The results of this assessment indicate that there are several potential biases that can influence the validity of AMR surveillance information and, therefore, the potential for bias should be considered in the interpretation and use of AMR surveillance data. BACKGROUND: The validity of surveillance systems has rarely been a topic of investigation. OBJECTIVE: To assess potential biases that may influence the validity of contemporary antimicrobial‐resistant (AMR) pathogen surveillance systems. METHODS: In 2008, reports of laboratory‐based AMR surveillance systems were identified by searching Medline. Surveillance systems were appraised for six different types of bias. Scores were assigned as ‘2’ (good), ‘1’ (fair) and ‘0’ (poor) for each bias. RESULTS: A total of 22 surveillance systems were included. All studies used appropriate denominator data and case definitions (score of 2). Most (n=18) studies adequately protected against case ascertainment bias (score = 2), with three studies and one study scoring 1 and 0, respectively. Only four studies were deemed to be free of significant sampling bias (score = 2), with 17 studies classified as fair, and one as poor. Eight studies had explicitly removed duplicates (score = 2). Seven studies removed duplicates, but lacked adequate definitions (score = 1). Seven studies did not report duplicate removal (score = 0). Eighteen of the studies were considered to have good laboratory methodology, three had some concerns (score = 1), and one was considered to be poor (score = 0). CONCLUSION: Contemporary AMR surveillance systems commonly have methodological limitations with respect to sampling and multiple counting and, to a lesser degree, case ascertainment and laboratory practices. The potential for bias should be considered in the interpretation of surveillance data.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,220
Score d'incertitude au seuil0,987

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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