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Enregistrement W51342837 · doi:10.1007/978-1-61779-498-8_15

Analysis of Aggrecan Catabolism by Immunoblotting and Immunohistochemistry

2011· article· en· W51342837 sur OpenAlexafffund
Peter J. Roughley, John S. Mort

Notice bibliographique

RevueMethods in molecular biology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtease and Inhibitor Mechanisms
Établissements canadiensShriners Hospitals for Children - Canada
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésAggrecanKeratan sulfateAggrecanaseChondroitin sulfateADAMTSChemistryExtracellular matrixCartilageMatrix metalloproteinaseProteolysisCell biologyOsteoarthritisBiochemistryMetalloproteinaseGlycosaminoglycanBiologyAnatomyArticular cartilagePathologyMedicineThrombospondinEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aggrecan is essential for the normal function of articular cartilage and intervertebral disc, where it provides the ability for the tissues to withstand compressive loading. This property depends on both the high charge density endowed by its numerous chondroitin sulfate and keratan sulfate chains and its ability to form large molecular aggregates via interaction with hyaluronan. Degradation of aggrecan via the action of proteases takes place throughout life and the degradation products accumulate in the tissue and impair its function. Such degradation is exacerbated in degenerative or inflammatory joint disorders. The use of antibodies recognizing the various regions of aggrecan and the neoepitopes generated upon proteolytic cleavage has shown that matrix metalloproteinases and aggrecanases, members of the ADAMTS family, are responsible for aggrecan degradation, both throughout life and in disease. By using immunoblotting techniques, it is possible to determine the extent of aggrecan degradation and to identify the degradation products that have accumulated in the tissue, and immunohistochemistry allows the location of the aggrecan degradation to be established.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,338
Écart entre enseignants0,325 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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