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Enregistrement W52393498 · doi:10.1096/fasebj.23.1_supplement.668.3

Membrane protein quality control in post‐Golgi compartments

2009· article· en· W52393498 sur OpenAlexafffund
Pirjo M. Apaja, Gergely L. Lukács

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésProteostasisEndosomeCell biologyChimera (genetics)InternalizationUbiquitinUbiquitin ligaseProtein foldingGolgi apparatusMutantChemistryEndoplasmic-reticulum-associated protein degradationUnfolded protein responseBiologyCellIntracellularBiochemistryEndoplasmic reticulum

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Elimination of non‐native polypeptides is critical for protein quality control (QC) and fundamental to preserve cellular proteostasis. The "peripheral" QC of cell surface membrane proteins (MP) remains poorly understood. To uncover the principles of MPQC in post‐Golgi compartments, we engineered chimeric CD4 molecules containing wt and temperature‐sensitive mutant l domain. The mutant was accumulated at the cell surface and unfolded at the non‐permissive temperature. Increased internalization and impaired recycling accounts for the metabolic destabilization of the unfolded chimera at the cell surface. The postendocytic sorting of the internalized chimeras was conformational‐dependent; unfolding redirected the chimera from constitutive recycling towards lysosomal degradation. Ubiquitination plays a pivotal role in the non‐native chimera degradation since; a) the chimera ubiquitination was enhanced several fold upon unfolding, 2) depletion of ubiquitin‐dependent endosomal sorting machinery (Hrs, Stam‐2 and Tsg101) delayed lysosomal delivery and 3) physical and functional association of the misfolded variant with an E3 Ub‐ligase could be identified. We propose a working model for the peripheral QC of MPs with a central role in cellular proteostasis and the etiology of conformational diseases. Supported by CIHR.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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