Identification of variants of 5‐lipoxygenase mRNA in human B lymphocytic cell lines
Notice bibliographique
Résumé
5-lipoxygenase (5-LO) catalyzes the initial reactions leading to the conversion of arachidonic acid into a number of biologically important mediators of inflammation. We seek to better understand the control of the biosynthesis of 5-LO products which is linked to inflammatory diseases such as asthma and atherosclerosis. In this study we used the human acute lymphocytic leukemia and Burkitt lymphoma cell lines REH and Raji, respectively, to investigate whether alternative variants of 5-LO mRNA are produced. Using reverse-transcription of extracted mRNA coupled with PCR, followed by molecular cloning and sequencing experiments, we have identified 4 different variants of 5-LO mRNA in these cell lines including the full length mRNA containing all 14 exons with the expected splicing sites. Amongst the alternative isoforms, one resulting from the exclusion of exon 13 was identified in both cell lines and was present in approximately 30% of the generated clones. This exclusion of exon 13 does not induce a reading frame shift but would result in a translation product missing 57 amino acids near the carboxyl terminal. Experiments are underway to determine whether the translation products of these variant isoforms are expressed and have an impact on the capacity of cells to synthesize 5-LO products. (Supported by the Canadian Institutes of Health Research and the Canada Research Chairs Program)
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».