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Three differentially expressed survivin cDNA variants encode proteins with distinct antiapoptotic functions

2000· article· en· W54712678 sur OpenAlexaff
Edward M. Conway, Saskia Pollefeyt, Jan J. Cornelissen, Inky DeBaere, Marta Steiner‐Mosonyi, Kelly Ong, Mathijs Baens, D Collen, Andre C. Schuh

Notice bibliographique

RevueBlood · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCell death mechanisms and regulation
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSurvivinBiologyAlternative splicingExonComplementary DNAMolecular biologyMessenger RNAGeneGene isoformOpen reading frameRNA splicingPeptide sequenceAmino acidGeneticsRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Survivin is a member of the inhibitor of apoptosis protein (IAP) family that is believed to play a role in oncogenesis. To elucidate further its physiologic role(s), we have characterized the murine survivin gene and complementary DNA (cDNA). The structural organization of the survivin gene, located on chromosome 11E2, is similar to that of its human counterpart, both containing 4 exons. Surprisingly, 3 full-length murine survivin cDNA clones were isolated, predicting the existence of 3 distinct survivin proteins. The longest open reading frame, derived from all 4 exons, predicts a 140-amino acid residue protein, survivin(140), similar to human survivin, which contains a single IAP repeat and a COOH-terminal coiled-coil domain that links its function to the cell cycle. A second cDNA, which retains intron 3, predicts the existence of a 121-amino acid protein, survivin(121) that lacks the coiled-coil domain. Removal of exon 2-derived sequences by alternative pre-messenger RNA (mRNA) splicing results in a third 40-amino acid residue protein, survivin(40), lacking the IAP repeat and coiled-coil structure. Predictably, only recombinant survivin(140) and survivin(121) inhibited caspase-3 activity. All 3 mRNA species were variably expressed during development from 7.5 days postcoitum. Of the adult tissues surveyed, thymus and testis accumulated high levels of survivin(140) mRNA, whereas survivin(121)-specific transcripts were detected in all tissues, while those representing survivin(40) were absent. Human counterparts to the 3 survivin mRNA transcripts were identified in a study of human cells and tissues. The presence of distinct isoforms of survivin that are expressed differentially suggests that survivin plays a complex role in regulating apoptosis. (Blood. 2000;95:1435-1442)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,300
Score d'incertitude au seuil0,508

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,192
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations173
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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