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Enregistrement W566175348 · doi:10.1096/fasebj.25.1_supplement.121.4

Solution structure and amino acid residues of C‐terminal RAGE (ctRAGE) involved in binding to Dia‐1 FH1 and its signaling

2011· article· en· W566175348 sur OpenAlexaff
Vivek Rai, Andres Y. Maldonado, Shi‐Fang Yan, Ann Marie Schmidt, Alexander Shekhtman

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced Glycation End Products research
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRage (emotion)Cell biologySignal transductionCytoplasmPhosphorylationReceptorChemistryBiologyBiochemistryNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The receptor for advanced glycation end products (RAGE) is a multiligand cell surface macromolecule that binds distinct ligands implicated in diabetes and inflammation. RAGE-dependent signal transduction is critically dependent on its short cytoplasmic domain and our recent work revealed that FH1 domain of Dia-1 binds to cytoplasmic tail (ct)RAGE. However, the cytoplasmic domain structure and pathways by which RAGE signals through mDia1 have yet to be fully explored. Here we present the solution structure of RAGE cytoplasmic domain and identify the Dia1-ctRAGE interaction surface. Using in-vitro NMR binding studies, we show that two amino acids, which are part of the Dia1-ctRAGE interaction surface, R5 and Q6 of ctRAGE are essential for interactions with Dia1. To confirm the Dia1-ctRAGE interaction surface we generated the ctRAGE double mutant where residues R5 and Q6 were changed to alanine to create R5AQ6A-ctRAGE and tested the hypothesis that RAGE mediated signaling proceeds via these residues. mDia-1 FH1 domain interacts with ctRAGE and is essential for ERK, AKT, JNK activation and GSK3beta phosphorylation signaling triggered by RAGE ligands. Our findings present the ctRAGE structure and establish a novel mechanism by which an extracellular signal initiated by RAGE ligands regulates RAGE signaling in a manner requiring Dia-1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,229

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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