Sequential growth of long DNA strands with user-defined patterns for nanostructures and scaffolds
Notice bibliographique
Résumé
DNA strands of well-defined sequence are valuable in synthetic biology and nanostructure assembly. Drawing inspiration from solid-phase synthesis, here we describe a DNA assembly method that uses time, or order of addition, as a parameter to define structural complexity. DNA building blocks are sequentially added with in-situ ligation, then enzymatic enrichment and isolation. This yields a monodisperse, single-stranded long product (for example, 1,000 bases) with user-defined length and sequence pattern. The building blocks can be repeated with different order of addition, giving different DNA patterns. We organize DNA nanostructures and quantum dots using these backbones. Generally, only a small portion of a DNA structure needs to be addressable, while the rest is purely structural. Scaffolds with specifically placed unique sites in a repeating motif greatly minimize the number of components used, while maintaining addressability. This combination of symmetry and site-specific asymmetry within a DNA strand is easily accomplished with our method. Assembling defined sequences of DNA is important for many applications, but the synthesis becomes more difficult as the target size increases. Here, the authors report a method for assembling DNA by combining smaller strands, with the final structure determined by the order of addition of the fragments.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».