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Enregistrement W57568958 · doi:10.1096/fasebj.24.1_supplement.850.5

Arachidonoyl substrate specificity of diacylglycerol kinases

2010· article· en· W57568958 sur OpenAlexafffundabout
Yulia V. Shulga, Matthew K. Topham, Richard M. Epand

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReceptor Mechanisms and Signaling
Établissements canadiensHealth Sciences CentreMcMaster University Medical Centre
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésDiacylglycerol kinaseMoietyBiochemistryArachidonic acidEnzymeGene isoformKinaseSubstrate (aquarium)MutantChemistryIsozymeCell biologyProtein kinase CBiologyStereochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Diacylglycerol kinases (DGKs) are an important class of lipid signaling enzymes. DGKε is unique among DGK isoforms in having specificity for DAG substrates with an arachidonate moiety. This contributes to the enrichment of lipid intermediates in the PI‐cycle with arachidonate. The importance of DGKε in neuronal function has been demonstrated in studies with knockout mice. We have shown that removal of 58 residues from the amino terminus of this protein, including the membrane‐inserting segment, had a negligible effect on substrate specificity. It is intriguing that the domain, responsible for DGKε specificity for DAG substrates with an arachidonate moiety, still is unknown. We have now identified a region of DGKε containing four conserved residues, very similar to those found responsible for recognition of arachidonic acid in lipoxygenases. We demonstrated that several mutations within this region of DGKε significantly impact enzyme activity, decreasing it to less than 2% of the activity of wild‐type DGKε. Moreover, the mutants showed a lower ratio of the enzyme activity with a DAG substrate containing an arachidonate moiety to substrates without an arachidonate moiety. The relationship of this finding to the substrate specificity of other isoforms of DGK is also explored. (Supported by the Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada, grant 9848)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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