Gastric Biopsies: The Gap between Evidence-Based Medicine and Daily Practice in the Management of Gastric<i>Helicobacter pylori</i>Infection
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Many consider histology to be the gold standard for Helicobacter pylori detection. Because the number and distribution of H pylori organisms vary, particularly in patients taking proton pump inhibitors (PPIs), the American Gastroenterological Association recommends discontinuing PPIs two weeks before endoscopy, and taking biopsies from both the body and antrum. OBJECTIVE: To assess the influence of clinical practice on the histopathological detection of H pylori infection. METHODS: Electronic patient records were evaluated for the sites of gastric sampling and PPI use at endoscopy. One hundred fifty cases with biopsies taken from both antrum and body were randomly selected for pathological re-review with special stains. The gastric regions sampled, H pylori distribution and influence of clinical factors on pathological interpretation were assessed. RESULTS: Between 2005 and 2010, 10,268 biopsies were taken to detect H pylori. Only one region was sampled in 60% of patients (antrum 47%, body 13%). Re-review of biopsies taken from both antrum and body indicated that the correct regions were sampled in only 85 (57%) patients. Of these, 54 were H pylori positive and 96 were H pylori negative. H pylori was present in the antrum in only 15% of the patients and body only in 21%. Of 96 H pylori-negative patients, two were reinterpreted as positive. Forty-seven per cent of patients were taking PPIs at endoscopy, contributing to both false-negative and false-positive diagnoses. CONCLUSION: Despite national and international guidelines for managing H pylori infection, the American Gastroenterological Association guidelines are infrequently adhered to, with PPIs frequently contributing to false diagnosis; sampling one region only increases the likelihood of missing active infection by at least 15%.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,056 | 0,137 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,004 |
| Communication savante | 0,007 | 0,007 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,005 | 0,004 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».