MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W60216173

Relationship between nucleic acid sequence, structure and function in terms of stabilizing interactions

2009· dissertation· en· W60216173 sur OpenAlexfundno aff
Petrina Kamya

Notice bibliographique

RevueSpectrum Research Repository (Concordia University) · 2009
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA and Nucleic Acid Chemistry
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaConcordia University
Mots-clésStackingContext (archaeology)Nucleic acidChemistryFunction (biology)Sequence (biology)Hydrogen bondLigand (biochemistry)MoleculeChemical physicsComputational chemistryBiological systemBiologyBiochemistryOrganic chemistry
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The relationship between nucleic acid (NA) sequence, structure and function is intricately connected to the stabilizing interactions (primarily hydrogen bonding and 1t-stacking) that occur between the monomeric subunits that constitute NAs. Therefore, detailed insights into the. nature of the stabilizing interactions would permit the full exploitation of the structure-function relationship in NAs. A complete understanding of the role of the stabilizing interactions in NAs involves the fulfillment of two requirements: 1) The ability to determine the electronic structure of the monomeric units (in terms of the electron density distribution as an observable) that make up the fundamental structure of NAs, which is possible through the use of quantum chemical calculations, and 2) The ability to characterize the electronic structure of these monomeric units in the context of realistic NA structures. Ideally, such molecular structures are determined experimentally. These two ideas are combined into a methodology that has been designed, tested and validated in the work presented here. The proof of concept culminates in the ability of the methodology to exploit the structure-function relationship in NAs through procurement of full stabilization profiles of host NA and guest (small molecule inhibitors to the function of the NA) complexes, where the potential inhibitors were designed on the basis of the stabilization profiles of the host and natural ligand complexes

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,172
Score d'incertitude au seuil0,980

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueSpectrum Research Repository (Concordia University)Même sujetDNA and Nucleic Acid ChemistryTravaux en français237 207