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Enregistrement W60740001 · doi:10.1096/fasebj.21.6.lb24-d

Display of large enzyme complexes on the cell surface of <i>Bacillus subtilis</i>

2007· article· en· W60740001 sur OpenAlexaff
Wai Mui Tjia, Erica Lindquist, Sau‐Ching Wu, Sui‐Lam Wong

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiochemical and Structural Characterization
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésStreptavidinLinkerBiotinylationBacillus subtilisChemistryBiochemistryCell wallHydrolaseEnzymeCellProtein subunitFusion proteinBiotinBiophysicsBiologyRecombinant DNABacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The ability to display multi‐subunit enzyme complexes on the bacterial cell surface offers opportunities to degrade complex polymers such as plant cellulose in an efficient and cooperative manner. To develop an engineered nanomachinery for surface display of enzymes, a fusion protein consists of streptavidin followed by a flexible linker and a cell wall binding domain derived from Bacillus subtilis cell wall hydrolase, LytE, is designed. Since each streptavidin subunit can self‐assemble into the tetrameric state and capture an enzyme (β‐lactamase in this study) carrying a streptavidin binding tag (SBP), a 140‐kDa complex is expected to form. Also, the tetrameric streptavidin fusion can potentially enhance the cell wall binding avidity. To examine the display efficiency, linkers with different lengths (51 and 151 amino acids) in the streptavidin fusions are designed. SDS‐PAGE results showed that the streptavidin fusions could be displayed as tetramers on the cell surface. Enzyme assay and Western blot showed that SBP‐tagged β‐lactamase could be captured to the cell surface. Interestingly, cells displaying streptavidin fusions with a longer linker showed 44% higher β‐lactamase activity. Longer linker is suggested to offer better surface accessibility of the displayed streptavidin fusions. This system can potentially be applied to display one or multiple species of SBP‐tagged proteins on the cell surface.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,163

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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