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Enregistrement W62347977 · doi:10.1007/978-1-62703-673-3_11

Assessment of Antimicrobial (Host Defense) Peptides as Anti-Cancer Agents

2013· article· en· W62347977 sur OpenAlexaff
Susan E. Douglas, David W. Hoskin, Ashley L. Hilchie

Notice bibliographique

RevueMethods in molecular biology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntimicrobial Peptides and Activities
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAntimicrobialAntimicrobial peptidesHost (biology)CancerComputational biologyMicrobiologyBiologyChemistryEcologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cationic antimicrobial (host defense) peptides (CAPs) are able to kill microorganisms and cancer cells, leading to their consideration as novel candidate therapeutic agents in human medicine. CAPs can physically associate with anionic membrane structures, such as those found on cancer cells, causing pore formation, intracellular disturbances, and leakage of cell contents. In contrast, normal cells are less negatively-charged and are typically not susceptible to CAP-mediated cell death. Because the interaction of CAPs with cells is based on charge properties rather than cell proliferation, both rapidly dividing and quiescent cancer cells, as well as multidrug-resistant cancer cells, are targeted by CAPs, making CAPS potentially valuable as anti-cancer agents. CAPs often exist as families of peptides with slightly different amino acid sequences. In addition, libraries of synthetic peptide variants based on naturally occurring CAP templates can be generated in order to improve upon their action. High-throughput screens are needed to quickly and efficiently assess the suitability of each CAP variant. Here we present the methods for assessing CAP-mediated cytotoxicity against cancer cells (suspension and adherent) and untransformed cells (measured using the tritiated thymidine-release or MTT assay), and for discriminating between cell death caused by necrosis (measured using lactate dehydrogenase- or (51)Cr-release assays), or apoptosis and necrosis (single-stranded DNA content measured by flow cytometry). In addition the clonogenic assay, which assesses the ability of single transformed cells to multiply and produce colonies, is described.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,377
Écart entre enseignants0,355 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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