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Enregistrement W633834511

Investigation of Fluorescence Coherence Tomography for Optofluidic Applications

2014· dissertation· en· W633834511 sur OpenAlexaff
Lukas-Karim Merhi, Bhuvaneshwari Karunakaran, Sae‐Won Lee, Ash M. Parameswaran, Soumyo Mukherji, Debjani Paul, Mirza Faisal Beg, Marinko V. Šarunic

Notice bibliographique

RevueSummit (Simon Fraser University) · 2014
Typedissertation
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueOptical Coherence Tomography Applications
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOptical coherence tomographyFluorescenceTomographyCoherence (philosophical gambling strategy)OpticsBiomedical engineeringNanotechnologyComputer scienceMaterials sciencePhysicsEngineering
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Conventional Flow Cytometers (FC) and Fluorescence-Activated-Cell-Sorters (FACS) are mechanically complex, bulky, and require specialized human operators, large sample volumes, and sample preparation procedures for proper diagnosis of diseases such as leukemia and malaria. For this reason, there has been an increasing demand for miniaturization, reduction of cost, and portability of such devices. Lab-on-a-chip devices, which integrate microfluidics with other technologies, have been emerging as a potential solution to miniaturization of FC/FACS technology. One serious limitation of lab-on-a-chip devices is their inability to extract shape or morphological information which is very useful for cell differentiation and characterization. To meet this challenge, optical imaging techniques and microfluidics are combined to form a subset field in ‘optofluidics’. This thesis will help explore this field which describes systems that combine optics and microfluidics. In this thesis, as proof of principle, the integration of a novel optical imaging technique called Fluorescence Coherence Tomography (FCT) with microfluidics is presented. The FCT was used to measure the position of flowing fluorescent particles in the cross section of the microfluidic channel (perpendicular to the direction of flow). This type of measurement was motivated by recent reports in the literature demonstrating that a cell’s position in a microchannel is highly sensitive to its size and stiffness, which in turn are important biomarkers for cell classification. By combining FCT with microfluidics, the long term goal is to provide researchers and scientists with new possibilities for biological investigations in optofluidic applications. The preliminary results acquired through this work are important for future development of applications in the miniaturization of molecule specific flow cytometry.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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