MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W640859915

Inhibitory Effects of Securinine and Related Compounds on Toxoplasma gondii and Mechanistic Insights into Transcript-Specific Translational Repression in the Bradyzoite Developmental Stage

2015· article· en· W640859915 sur OpenAlexaff
Michael J. Holmes

Notice bibliographique

RevueScholarship at UWindsor (University of Windsor) · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueToxoplasma gondii Research Studies
Établissements canadiensUniversity of Windsor
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPsychological repressionBiologyToxoplasma gondiiDevelopmental stageInhibitory postsynaptic potentialGeneticsComputational biologyNeuroscienceGeneGene expressionPsychologyDevelopmental psychology
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Toxoplasma gondii is an intracellular protozoan parasite that infects warm blooded animals the world over. In the host, the parasite exists as either rapidly growing tachyzoites or immunologically protected slowly dividing bradyzoites. While tachyzoites are generally cleared by the host's immune system, bradyzoites persist for life. If the immune system becomes compromised, bradyzoites reconvert to tachyzoites and cause severe illness. Bradyzoites develop in response to stressful stimuli, therefore discovering factors that modulate bradyzoite conversion as well as determining how Toxoplasma's stress response pathways operate are essential to understanding parasite disease. In this work, the plant alkaloid securinine as well as ten pyrrolidine derivatives were shown to have in vitro anti-Toxoplasma activity in the micromolar range. These compounds act in different capacities, either restricting parasite's invasion or by reducing the parasite's rate of replication. One of the hallmarks of the bradyzoite life stage is slowed replication. When tested, only securinine induced bradyzoite formation at comparable levels to treatment with alkaline media, suggesting that it initiates a stressful stimulus. When in the bradyzoite stage, Toxoplasma induces a global translational repression allowing for the remodeling of the transcriptome. However it remains unclear how certain transcripts are maintained throughout the long term translational repression seen in bradyzoites. Analysis of one such transcript, lactate dehydrogenase 1, showed a 40 nucleotide cis-acting element with its 5'UTR responsible for this activity. The formation of 16 nucleotide regulatory RNA hairpin is necessary for inducing sustained translational repression in bradyzoites, suggesting that it acts as a recognizable feature. Characterization of the transcript reveals that its poly(A) tail does not shorten in bradyzoites, indicating that it is likely targeted for long term storage instead of degraded under stress. Efforts were made to capture and analyse the protein complement interacting with the cis-acting element using RNA aptamer technologies, however they were unfruitful. Using extracellular parasites, it was determined that a rapid induction of stress is insufficient to selectively repress the transcript. This suggests that the reprogramming of the proteome may be necessary for the sustained translational repression of lactate dehydrogenase 1 in Toxoplasma bradyzoites.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueScholarship at UWindsor (University of Windsor)Même sujetToxoplasma gondii Research StudiesTravaux en français237 207