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Enregistrement W648204534 · doi:10.1007/978-1-59745-394-3

Hepatitis C: Methods and Protocols

2009· book· en· W648204534 sur OpenAlexfundno aff
Hengli Tang

Notice bibliographique

RevueMethods in molecular biology · 2009
Typebook
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis C virus research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthÉcole Normale Supérieure de LyonCentre Hospitalier Universitaire VaudoisUniversité de LausannePfizerHospital for Sick ChildrenUniversità degli Studi di GenovaAlbert-Ludwigs-Universität FreiburgSaint Louis UniversityInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesFlorida State UniversityUniversite AngersUniversity of AlbertaOffice of International Science and EngineeringUniversität BaselYale UniversityLos Alamos National LaboratoryUniversité de LyonUniversität Heidelberg
Mots-clésVirologyHepatitis virusHepatitisHepatitis a virusMedicinePsychologyFamily medicineVirus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The NS5A protein of HCV is an essential component of the viral RNA replication machinery and may also function in modulation of the host cell environment. The exact function of NS5A in these processes remains unknown. NS5A is a large hydrophilic phosphoprotein protein consisting of three domains. The amino-terminal domain, designated domain I, coordinates a single zinc atom that is required for virus replication. We have determined the X-ray crystallographic structure of the domain I region of NS5A, and the structure sheds some light on the previously reported RNA binding activity observed for NS5A and suggests that the protein functions as a dimer. Here we describe the bacterial expression, purification, crystallization, and structural determination of the amino-terminal domain I of NS5A. The methods described herein should be of use for the generation of domain I for biochemical studies as well as future crystallization studies as antiviral compounds directed against this region of NS5A become available.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,080
Score d'incertitude au seuil0,267

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0040,002
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0030,003
Intégrité de la recherche0,0020,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0800,154

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,075
Tête enseignante GPT0,548
Écart entre enseignants0,473 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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