Genetic modifiers of ambulation in the CINRG duchenne natural history study.
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
We studied the effects of LTBP4 and SPP1 polymorphisms on age at loss of ambulation (LoA) in a multiethnic Duchenne muscular dystrophy cohort (DMD). We genotyped SPP1 rs28357094 and LTBP4 haplotype in 283/340 participants in the Cooperative International Neuromuscular Research Group Duchenne Natural History Study (CINRG-DNHS). Median ages at LoA were compared by Kaplan-Meier analysis and log-rank test. We controlled polymorphism analyses for concurrent effects of glucocorticoid corticosteroid (GC) treatment (time-varying Cox regression), and for population stratification (multidimensional scaling of genome-wide markers). Hispanic and South Asian participants (n = 18, 41) lost ambulation 2.7 and 2 years earlier than Caucasian (p = 0.003, <0.001). The TG/GG genotype at SPP1 rs28357094 was associated to 1.2-year earlier median LoA (p = 0.048). This difference was greater (1.9 years, p = 0.038) in GC-treated participants, whereas no difference was observed in untreated. Cox regression confirmed a significant effect of SPP1 genotype in GC-treated participants (HR 1.61, p = 0.016). LTBP4 genotype showed a direction of association with age at LoA as previously reported, but not statistically significant. After controlling for population stratification, we confirmed a strong effect of LTBP4 genotype in Caucasians (2.4 years, p = 0.024). Median age at LoA with the protective LTBP4 genotype in this cohort was 15.0 years, 16.0 if GC-treated. In conclusion, SPP1 rs28357094 acts as a pharmacodynamic biomarker of GC response, and LTBP4 haplotype modifies age at LoA in the CINRG-DNHS cohort. Adjustment for GC treatment and population stratification appears crucial in assessing genetic modifiers in DMD.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle