Nuclear Localization and Biological Function of Matrix Metalloproteinase‐2
Notice bibliographique
Résumé
Matrix metalloproteinases (MMPs) are zinc‐dependent proteases that are involved in intra‐ and extra‐cellular matrix remodeling associated with developmental processes and disease progression. Several MMPs including MMP‐2 have been found in the nucleus. The biological functions and substrates of nuclear MMPs are mostly unknown. We hypothesize that MMP‐2 is present in the nucleus under physiological conditions but increases during oxidative stress to proteolyse structural and DNA repair proteins. Lamin A/C, a possible nuclear MMP‐2 target, is an intermediate filament protein that provides structural support to the nuclear envelope. Cytosolic, membrane and nuclear fractions were extracted from blood‐free, isolated rat hearts. Western blots for MMP‐2, lamin A/C (nuclear marker), SERCA2 (membrane marker) and GAPDH (cytosol marker) were used to demonstrate fraction purity. This showed that the nuclear fraction was free of cytosolic and membrane contamination and MMP‐2 was detected in all three fractions. MMP‐2 activity (by gelatin zymography) showed that nuclear MMP‐2 activity was lowest compared to that in the cytosolic and membrane fractions. The presence of nuclear MMP‐2 was examined by immunofluorescence confocal microscopy in HT1080 fibrosarcoma cells. Recombinant lamin A/C was proteolysed into 50 and 25 kDa fragments by incubation with MMP‐2 (0.5h, 37 o C) in vitro and this was blocked by the MMP inhibitor o‐phenanthroline. MMP‐2 is present in highly purified nuclear fractions obtained from rat hearts and in the nuclei of HT1080 cells. Ongoing experiments will determine the colocalization of MMP‐2 with nuclear bodies, its nuclear substrates and therefore its function within nuclei. Support: CIHR.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».