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Enregistrement W67296420 · doi:10.1096/fasebj.21.5.a534

Proteomic‐based identification of upstream intermediates of Na+i,K+i‐independent death signaling triggered by interaction of cardiotonic steroids with alpha‐subunit of Na,K‐ATPase

2007· article· en· W67296420 sur OpenAlexafffundabout
Olga A. Akimova, Pavel Hamet, Sergei N. Orlov

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesKidney Foundation of Canada
Mots-clésOuabainSignal transductionG alpha subunitChemistryATPaseCell biologyProtein subunitWestern blotReceptorImmunoprecipitationPhosphataseBiologyPhosphorylationBiochemistryEnzymeSodium

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

During the last decade, it was shown that side‐by‐side with a major role in regulation of Na + i /K + i ratio, interaction of the Na,K‐ATPase with ouabain and other cardiotonic steroids (CTS) triggers diverse Na + i ,K + i ‐ independent signaling involved in cell proliferation and death. Thus, we demonstrated that chronic exposure to CTS results in massive death of renal epithelial, vascular endothelial and colon epithelial (Caco‐2) cells via their interaction with Na,K‐ATPase α‐subunit but independently of elevation of [Na + ] i /[K + ] i ratio. We designed this study to identify upstream intermediates of this novel CTS‐induce Na + i ,K + i ‐ independent signaling pathway using proteomic‐based approaches. We used cell lysates from control and ouabain‐treated Caco‐2 cells for co‐immunoprecipitation with anti‐α1 Na,K‐ATPase antibodies following by separation with 2D‐PAGE. From comparative analyse we detected more than 20 proteins sports whose interaction with Na,K‐ATPase was triggered by ouabain. 18 proteins were identified by mass spectrometry, including 8 signaling proteins from superfamilies of glucocorticoid receptors, Ser/Thr protein kinases and 2C phosphatases, Src and Rho GTPases. The role of these proteins in ouabain‐induced Na + i , K + i ‐ independent cell death signaling is currently under investigation. Supported by grants from the Canadian Institute of Health Research and the Kidney Foundation of Canada .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,022
Score d'incertitude au seuil0,319

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2007
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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