NOTCH1 genetic variants in patients with tricuspid calcific aortic valve stenosis.
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND AND AIM OF THE STUDY: Calcific aortic valve stenosis (AS) affects 2-5% of the population aged > 65 years. Functional DNA variants at the NOTCH1 locus result in bicuspid aortic valve (BAV) and severe valve calcification. The contribution of these variants to AS in the population with tricuspid aortic valve (TAV) remains to be determined. METHODS: Fourteen genetic variants surrounding the NOTCH1 gene were genotyped, including rare mutations previously reported, and common polymorphisms. The study involved 457 French Canadian patients with severe tricuspid AS. Genotyping was carried out using the Illumina BeadXpress platform. Allele frequencies of common single nucleotide polymorphisms (SNPs) for patients with AS were compared to a shared control group of European ancestry (n = 3,294). In total, 88 ancestry-informative markers were used to correct for population stratification. RESULTS: The mutation R1107X, previously associated with AS and BAV, was identified in a relatively young patient (aged 58 years). The mutations R1279H and V2285I were detected in 18 and 14 heterozygotes, respectively. A common polymorphism (rs13290979) located in intron 2 was significantly associated with AS (p = 0.003), which remained significant after correction for multiple testing. However, this association was no longer significant after accounting for population stratification (p = 0.088). CONCLUSION: In this study, rare functional variants were found in the NOTCH1 gene in a French Canadian population of patients with severe tricuspid AS. This also suggests, for the first time, the presence of a common polymorphism in this gene conferring susceptibility to AS.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».