Induction of RNA‐binding proteins in denervated skeletal muscle
Notice bibliographique
Résumé
Several transcriptional mechanisms are known to be involved in the atrophic response of skeletal muscle. However, emerging data lead us to hypothesize that post‐transcriptional events, operating at the level of mRNA stability, are also contributing. We thus initiated a series of studies to determine the role of post‐transcriptional mechanisms in the response of muscle to disuse. Given the key role of AU‐rich elements (ARE) located in the 3′UTR of multiple mRNAs in controlling their stability, we focused on the contribution of RNA‐binding proteins (RBP) known to interact with this cis‐element. Specifically, we examined expression of HuR, AUF1, TTP, BRF1 and KSRP in slow vs fast muscles as well as in denervated muscles. In general, expression of these RBP was higher in slow muscles. Additionally, a time course of hindlimb denervation ranging from 12 hours to 14 days revealed that the major changes occurred early, i.e. within 2 days of denervation. The most dramatic changes consisted in a substantial increase in expression of the mRNA destabilizing factors TTP and its homolog BRF1 in fast muscles. Since these factors bind to ARE found in multiple important mRNAs, our results identify new molecular mechanisms that likely play a key role in the atrophic response of muscle. Also, they provide additional targets that may be useful for developing novel therapeutics aimed at countering muscle atrophy. Funded by CNES, AFM, MDA and CIHR.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».