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Enregistrement W68445963 · doi:10.1096/fasebj.21.6.a1306

Induction of RNA‐binding proteins in denervated skeletal muscle

2007· article· en· W68445963 sur OpenAlexafffund
Angèle Chopard, Anu Heidi Shukla, John A. Lunde, Bernard J. Jasmin

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCentre National d’Etudes SpatialesAssociation Française contre les MyopathiesMinnesota Department of Agriculture
Mots-clésDenervationSkeletal muscleMessenger RNARNA-binding proteinMuscle atrophyCell biologyUntranslated regionHindlimbBiologyAtrophyRNAInternal medicineGene expressionEndocrinologyChemistryMedicineBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Several transcriptional mechanisms are known to be involved in the atrophic response of skeletal muscle. However, emerging data lead us to hypothesize that post‐transcriptional events, operating at the level of mRNA stability, are also contributing. We thus initiated a series of studies to determine the role of post‐transcriptional mechanisms in the response of muscle to disuse. Given the key role of AU‐rich elements (ARE) located in the 3′UTR of multiple mRNAs in controlling their stability, we focused on the contribution of RNA‐binding proteins (RBP) known to interact with this cis‐element. Specifically, we examined expression of HuR, AUF1, TTP, BRF1 and KSRP in slow vs fast muscles as well as in denervated muscles. In general, expression of these RBP was higher in slow muscles. Additionally, a time course of hindlimb denervation ranging from 12 hours to 14 days revealed that the major changes occurred early, i.e. within 2 days of denervation. The most dramatic changes consisted in a substantial increase in expression of the mRNA destabilizing factors TTP and its homolog BRF1 in fast muscles. Since these factors bind to ARE found in multiple important mRNAs, our results identify new molecular mechanisms that likely play a key role in the atrophic response of muscle. Also, they provide additional targets that may be useful for developing novel therapeutics aimed at countering muscle atrophy. Funded by CNES, AFM, MDA and CIHR.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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