Investigating the Polymicrobial Nature of Bovine Digital Dermatitis in Natural Infections and Animal Models
Notice bibliographique
Résumé
Digital Dermatitis (DD) is a multifactorial, polymicrobial skin disease on cattle’s feet and is the leading cause of lameness in Canadian dairy cattle, with an etiology that remains unclear. This thesis aimed to investigate the polymicrobial nature of DD by identifying potential bacterial reservoirs and investigating the roles of specific bacteria in lesion initiation in natural infections. Additionally, efforts were made to optimize a bovine infection model. Four studies were conducted, three field studies in commercial dairy farms and an experimental infection study. We relied on quantitative molecular techniques, real-time qPCR, targeting three DD-associated Treponema spp. and four other anaerobes. First, we validated swabs as an alternative to invasive skin biopsies in detecting and quantifying DD bacteria. We then mapped and quantified DD bacteria in potential reservoirs in dairy cows from herds with or without DD. Next, we assessed the temporal changes in bacterial counts preceding lesions and determined whether bacterial presence in reservoirs was persistent or transient in a longitudinal study. Finally, we explored a novel tattoo-based inoculation method to optimize DD bovine models. DD-Treponema spp. were detected only in DD-affected herds, while non-treponemal anaerobes were widespread in both affected and DD-negative herds. Although all target bacterial species were occasionally detected on healthy skin and in saliva, only Porphyromonas levii and Fusobacterium necrophorum seem to persist in these sites. Despite their detection in environmental samples, we did not detect any of the target species in feces. All target species increased in numbers before lesion onset, with sequential colonization starting with non-treponemes two weeks before DD occurred, followed by DD-Treponema spp. Lastly, the tattooing method showed potential for future use in experimental induction of DD by depositing Treponema spp. at the epidermis-dermis junction; however, we were unable to induce lesions in dairy calves likely due to factors missing in our model. While DD etiology remains undetermined, this thesis supports the key role of Treponema spp. in the disease, offers a change in perspective on the involvement of non-treponemes in lesion initiation, discusses the challenges in reproducing this disease experimentally, and proposes a hypothetical scheme of pathogenesis for this complex disease.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».