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Enregistrement W6884643746 · doi:10.1158/1538-7445.am2025-6270

Abstract 6270: Al-derived tumor-infiltrating lymphocytes predicts risk of invasive breast cancer recurrence in ductal carcinoma in situ (DCIS)

2025· article· en· W6884643746 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSingle-cell and spatial transcriptomics
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésContext (archaeology)Tumor-infiltrating lymphocytesBreast cancerStromal cellDuctal carcinomaCancerEstrogen receptorCohortTumor microenvironment

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background: The abundance of tumor-infiltrating lymphocytes (TILs) has demonstrated prognostic value in breast cancer recurrence. However, manual TIL assessment is both time-consuming and prone to inter-observer variability. This study aimed to evaluate the performance of two AI-based TIL scoring pipelines, emphasizing the added value of incorporating tissue-based context insights for automated TILs scoring. Methods: We compared two in-house AI-based TILs scoring pipelines using the Translational Breast Cancer Research Consortium DCIS cohort. The first pipeline employs single-cell classification to identify epithelial, lymphocyte, stromal, and other cell types, followed by spatial analysis of immune populations relative to epithelial cells through clustering (AI-TILs-cluster). The second pipeline builds on this foundation by integrating a tumor microenvironment segmentation model as context guidance to compute the proportion of lymphoid cells within the epithelium and stromal compartments (AI-TILs-seg). In a cohort of 45 retrospectively collected hematoxylin and eosin (HE)-stained whole-slide tissue sections from 38 patients with available pathologists manual TILs, we evaluated the correlation of both scores and the median manual TIL score across the pathologists. Additionally, we assessed the prognostic value of the AI-derived TILs in 232 patients (530 HE slides) with up to 228 follow-up months (median: 78 months) by examining the association of per-patient AI-TILs with time to invasive breast cancer recurrence. This analysis was conducted using a multivariate Cox Proportional Hazards model that included patient age, tumor grade, DCIS lesion size, and estrogen receptors (ER) and progesterone receptors (PR) status. Results: AI-TILs-cluster was not significantly correlated with median pathologist TILs, AI-TILs-seg, however, demonstrated a moderate correlation (Spearman’s rho = 0.43, p = 0.003). This finding was expected as the automatic scores were not designed to replicate the manual TILs. AI-TILs-seg was associated with an increased risk of invasive breast cancer (Hazard Ratio = 1.067, 95% Confidence Interval: 1.017-1.119, p= 0.008) independent of other variables. In comparison, the multivariate analysis including AI-TILs-cluster did not show significance in predicting the risk of invasive breast cancer. Conclusion: These findings suggest that incorporating contextual tumor microenvironment segmentation can enhance AI-derived TIL scoring, leading to better alignment with pathologist assessments and improved clinical relevance. Future work will focus on validating this scoring approach in larger cohorts and improving correlation with pathologist TILs. Citation Format: Sara Ranjbar, Xiaoxi Pan, Karina Pinao, Caner Ercan, Roberto Salgado, Hugo M. Horlings, Allison Hall, Lorraine M. King, Carlo Maley, E Shelly Hwang, Yinyin Yuan, Simon Castillo, Pingjun Chen. Al-derived tumor-infiltrating lymphocytes predicts risk of invasive breast cancer recurrence in ductal carcinoma in situ (DCIS) [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2025; Part 1 (Regular Abstracts); 2025 Apr 25-30; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2025;85(8_Suppl_1):Abstract nr 6270.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,330
Écart entre enseignants0,299 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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