Taxonomy And Phylogenetics Of The Peromyscus Maniculatus Species Group
Notice bibliographique
Résumé
This dataset contains the digitized treatments in Plazi based on the original journal article Greenbaum, Ira F., Honeycutt, Rodney L., Chirhart, Scott E. (2019): Taxonomy And Phylogenetics Of The Peromyscus Maniculatus Species Group. Special Publications of the Museum of Texas Tech University 71: 559-575, DOI: 10.5281/zenodo.7221125ABSTRACTAn overview is provided herein of advancements in the species composition and phylogenetics of the Peromyscus maniculatus species group since Carleton’s 1989 review of the genus. These advancements primarily are the result of studies of chromosomal and nucleotide-sequence variation, with most sequence data derived from the mitochondrial genome. Evidence is summarized supporting the conclusion that variation in mitochondrial genes provides consistent and informative details relative to species-level identification and the phylogenetic relationships among major clades of deer mice. Based on studies of the mitochondrial cytochrome- b gene as well as previously published and new sequences of the mitochondrial ND3/ND4/ND4L genes, the number of species in the P. maniculatus group is increased to nine (P. melanotis, P. polionotus, P. keeni, P. arcticus, P. gambelii, P. sejugis, P. sonoriensis, P. labecula, and P. maniculatus). The newly identified species render P. maniculatus as being restricted to the northeastern United States and south-central Canada. The phylogenetic studies provide evidence of a sister-group relationship between the P. leucopus and P. maniculatus species groups and the placement of P. melanotis as basal to other members of the P. maniculatus group. The well-supported clade containing P. keeni and P. gambelii / P. sejugis appears to be best explained as having resulted from independent peripheral isolation. However, the available data fail to resolve the phylogenetic relationship of the clades corresponding to P. maniculatus sensu stricto, P. sonoriensis, P. polionotus, and P. keeni / P. gambelii / P. sejugis, and too little data exist to address the phylogenetic relationships of P. arcticus and P. labecula relative to the other species in the P. maniculatus species group. A more thorough resolution of the systematics of the species in the P. maniculatus group awaits broader and targeted geographic sampling and the inclusion of data from more rapidly evolving nucleotide sequences.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,006 | 0,005 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,012 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».