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Enregistrement W6890074063 · doi:10.3389/fmicb.2018.00773.s001

Image1_Atmospheric Precipitations, Hailstone and Rainwater, as a Novel Source of Streptomyces Producing Bioactive Natural Products.PDF

2018· other· en· W6890074063 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2018
Typeother
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueArtificial Intelligence in Education
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésStreptomycesArcticExtreme environmentStreptomyces griseus16S ribosomal RNAGenus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<p>A cultivation-dependent approach revealed that highly diverse populations of Streptomyces were present in atmospheric precipitations from a hailstorm event sampled in February 2016 in the Cantabrian Sea coast, North of Spain. A total of 29 bioactive Streptomyces strains isolated from small samples of hailstone and rainwater, collected from this hailstorm event, were studied here. Taxonomic identification by 16S rRNA sequencing revealed more than 20 different Streptomyces species, with their closest homologs displaying mainly oceanic but also terrestrial origins. Backward trajectory analysis revealed that the air-mass sources of the hailstorm event, with North Western winds, were originated in the Arctic Ocean (West Greenland and North Iceland) and Canada (Labrador), depending on the altitude. After traveling across the North Atlantic Ocean during 4 days the air mass reached Europe and precipitated as hailstone and rain water at the sampling place in Spain. The finding of Streptomyces species able to survive and disperse through the atmosphere increases our knowledge of the biogeography of genus Streptomyces on Earth, and reinforces our previous dispersion model, suggesting a generalized feature for the genus which could have been essential in his evolution. This unique atmospheric-derived Streptomyces collection was screened for production of bioactive secondary metabolites. Analyses of isolates ethyl acetate extracts by LC-UV-MS and further database comparison revealed an extraordinary diversity of bioactive natural products. One hundred molecules were identified, mostly displaying contrasted antibiotic and antitumor/cytotoxic activities, but also antiparasitic, antiviral, anti-inflammatory, neuroprotector, and insecticide properties. More interestingly, 38 molecules not identified in natural products databases might represent new natural products. Our results revealed for the first time an extraordinary diversity of Streptomyces species in the atmosphere able to produce an extraordinary repertoire of bioactive molecules, thus providing a very promising source for the discovery of novel pharmaceutical natural products.</p>

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,042

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0120,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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