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Enregistrement W6891724342 · doi:10.48448/pgga-dh21

Phosphorylation-dependent control of Activity-regulated cytoskeleton-associated protein (Arc) protein by Tnik

2021· other· en· W6891724342 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueUnderline Science Inc. · 2021
Typeother
Langueen
Domaine
Thématique
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésArc (geometry)Context (archaeology)PhosphorylationKinaseProtein–protein interactionAutophagy-related protein 13Subfamily

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The remarkable capacity of neurons to reorganize their structure, function, and connections in an activity-dependent manner is supported by an extensive network of molecules and effectors. Among those, the 'hub' protein Activity-regulated cytoskeleton-associated protein (Arc, also known as Arg3.1) can be considered one of the central, as well as most versatile, players. Notably, Arc has been shown to maintain direct interactions with key synaptic factors like PSD95, TARPγ2, and CaMKII, as well as participate in many aspects of neuroplasticity such as trafficking of AMPARs and modeling of dendritic spines. How a single protein like Arc can do all this remains difficult to explain, but a complete answer to that question will certainly include a mix of protein post-translational modifications acting to confer molecular and functional specificity. Recently, sequence analysis of Arc protein led us to recognize two candidate phosphorylation sites specific to TRAF2 and NCK-interacting protein kinase (TNIK)--a member of the Germinal Center Kinases (GCK) subfamily that is considered a possible risk factor to different psychiatric disorders, including schizophrenia and bipolar disorder. Here, we present extensive biochemical, proteomics, and electron microscopy evidence supporting the influence of TNIK on Arc's subcellular distribution and oligomerization. Together, our findings position Arc as a substrate of TNIK and offer exciting new scenarios implicating these two factors in the context of the pathophysiology and potential treatment of neuropsychiatric disorders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,342
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0010,004
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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