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Enregistrement W6891808595 · doi:10.48448/jrar-vz46

(G*) On the rationale for a standardized pre-clinical segmentation technique in PET pharmacokinetic

2021· other· en· W6891808595 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueUnderline Science Inc. · 2021
Typeother
Langueen
Domaine
Thématique
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSegmentationPositron emission tomographyPet imagingCardiac PETImage segmentationPattern recognition (psychology)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: A great challenge in quantitative dynamic positron emission tomography (PET) imaging is to determine the exact volumes of interest (VOI) with which one wants to work. They have a tremendous impact on the time-activity curves that are used to extract the pharmacokinetic coefficients. Since PET images are functional and not anatomical, using a bijective relationship with a computed tomography (CT) co-image is neither the sole nor the best possibility. In recent years, many publications have come with ingenious methods to work directly with the PET images, ranging from machine learning algorithms to manual toil to define regions. These techniques have different uses, mainly in the hope of enabling easier and more efficient tumor delimitation. In the case of dynamic images, the temporal aspect of the imaging procedure changes the methods that can be implemented. Furthermore, the need to delimitate specific and precise functional sites render the whole operation computationally and physically challenging, especially in the absence of a common and well-established methodology. Methodology: In this project, a novel approach using a gradient-based segmentation was used on pre-clinical dynamic PET images on rats. Fourteen different animals were used under similar pre-clinical conditions. The developed segmentation technique uses properties of the image itself, relying on already known properties of the radio-drug used in order to segment automatically the kidney of the animal. The work was conducted using the mini-PET scanner at the Montreal Neurological Institute, according to the ethical guideline from the University of Montréal and the Canadian Tri-Council. Results: From the preliminary data, the proposed method has a relevant rate of success on clinical images in delimitating the volumes of interest. The respective time-activity curves follow the general pattern of the manual delimitations done by experts, yet with non-negligible differences. So far, the proposed technique offers good result on 8 of the 14 rats, as compared to 12 rats when using a manual segmentation. The greatest strength of the algorithm is its ability to reproduce the same results notwithstanding the operator. The technique can also quantify movement in the organ of interest and work in spite of a great amount of Gaussian noise. Keywords: Nuclear Medicine, pre-clinical dynamic PET imaging, pharmacokinetic

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,023

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,005
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0040,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,008

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,062
Tête enseignante GPT0,419
Écart entre enseignants0,357 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
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