Data from: Patterns of genomic heterogeneity in a classic field cricket mosaic hybrid zone
Notice bibliographique
Résumé
Barriers to gene exchange can be semi-permeable; some genes are expected to freely flow across species boundaries whereas others, under divergent selection or responsible for reproductive isolation, might not. Genome scans in recently diverged species have identified divergent genomic regions, a pattern that has often been interpreted as islands of restricted introgression in a background of relatively free gene exchange (“genomic islands of speciation”). Areas of high differentiation, most located in the X chromosome (females XX, males X0), have been identified in the hybridizing field crickets Gryllus firmus and Gryllus pennsylvanicus. These species were assumed to follow an islands of speciation model, with highly differentiated areas interpreted as areas of reduced introgression. We sequenced the G. firmus genome to localize previously studied SNPs and sample a larger area around them in 8 allopatric populations (4 of each species). We use this data to test expectations for the islands model, in which non-introgressing areas should have both high absolute and relative differentiation. We find that in the allopatric populations, the areas with high relative differentiation (mostly X-linked), previously interpreted as non-introgressing, do not have high absolute differentiation as would be expected under the “islands model.”. We also show that the estimated divergence time based on nuclear DNA is about 4× older than that estimated based on mtDNA (800K vs 200K years ago). We discuss the implications of our results for introgression into allopatric populations.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,010 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».