Data from: Integrating phylogeography and paleoecology to investigate the origin and dynamics of hybrid zones: insights from two widespread North American firs
Notice bibliographique
Résumé
Secondary contact between closely related taxa routinely occurs during postglacial migrations. After initial contact, the location of hybrid zones may shift geographically or remain spatially stable over time in response to various selective pressures or neutral processes. Studying the extent and direction of introgression using markers having contrasted levels of gene flow can help unravel the historical dynamics of hybrid zones. Thanks to their contrasted maternal and paternal inheritance, resulting in different levels of gene flow for mitochondrial and chloroplast DNA (mtDNA and cpDNA), the Pinaceae stand out as a relevant biological model for this purpose. The objective of the study was to assess whether the hybrid zone between Abies balsamea and Abies lasiocarpa (two largely distributed Pinaceae) has moved or remained stable over time by analysing the distribution of cytoplasmic DNA variation as well as published palaeobotanical data. Interspecific gene flow was higher for cpDNA than mtDNA markers; hence, the geographic distribution of mitotypes was more congruent with species distributions than chlorotypes. This genetic signature was contrary to expectations under a moving hybrid zone scenario, as well as empirical observations in other conifers. Genetic evidence for this rare instance of stable hybrid zone was corroborated by the colonization chronology derived from published fossil data, indicating that the two fir species initially came into contact in the area corresponding to the current sympatric zone 11 kyr ago. While an explanatory analysis suggested the putative influence of various environmental factors on the relative abundance of cytoplasmic genome combinations, further research appears necessary to assess the role of both demographic history and selective factors in driving the dynamics of hybrid zones.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».