Genomic DNA of clinical M. abscessus strains
Notice bibliographique
Résumé
Introduction. Mycobacterium abscessus (Mab) is a pathogenic bacterium that can cause severe lung infections, particularly in individuals with cystic fibrosis. Mab colonies can exhibit either a smooth (S) or rough (R) morphotype, influenced by the presence or absence of glycopeptidolipids (GPL) on their surface, respectively. Despite the clinical significance of these morphotypes, the relationship between GPL levels, morphotype, and the pathogenesis of Mab infections remains poorly understood. Gap Statement. The mechanisms and implications of GPL production and morphotypes in clinical Mab infections are unclear. There is a gap in understanding their correlation with infectivity and pathogenicity, particularly in patients with underlying lung disease. Aim. This study aimed to investigate the correlation between Mab morphology, GPL, and infectivity by analysing strains from cystic fibrosis patients' sputum samples. Methodology. Mab was isolated from patient sputum samples and categorised by morphotype, GPL profile, and replication rate in macrophages. A high-content ex vivo infection model using THP-1 cells assessed the infectivity of both clinical and laboratory strains. Results. Our findings revealed that around 50% of isolates displayed mixed morphologies. GPL analysis confirmed a consistent relationship between GPL content and morphotype was only found only in smooth isolates. Across morphotype groups, no differences were observed in vitro, yet clinical R strains were observed to replicate at higher levels in the THP-1 infection model. Moreover, the proportion of infected macrophages was notably higher among clinical R strains compared to their S counterparts at 72 hours post-infection. Clinical variants also infected THP-1 cells at significantly higher rates compared to laboratory strains, highlighting the limited translatability of lab strain infection data to clinical contexts. Conclusion. Our study confirmed the general correlation between morphotype and GPL levels in smooth strains yet unveiled more variability within morphotype groups than previously recognised, particularly during intracellular infection. As the rough morphotype is of highest clinical concern, these findings contribute to the expanding knowledge base surrounding Mab infections, offering insights that can steer diagnostic methodologies, and treatment approaches.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,250 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».