Diversity and biogeography of Mediterranean freshwater blennies (Blenniidae, Salaria)
Notice bibliographique
Résumé
Aim: In the Mediterranean Biodiversity Hotspot freshwater fishes are key biogeographical indicators while their habitats are vulnerable to ongoing anthropogenic pressures. The freshwater blenny is a widespread endemic taxon in this area. However, our understanding of the overall diversity of specific populations and their phylogenetic relationships is sparse. Thus, we aim to investigate the genetic diversity, infer relationships among sampled populations related to major paleoenvironmental changes and suggest insights for future research and conservation targets. Location: Mediterranean Basin Methods: We studied 171 Salaria specimens from 51 rivers and lakes, and from 13 countries surrounding the Mediterranean Sea. For assessing the phylogenetic relationships among different locations, we used mtDNA d-loop and Intron S7 sequences. Furthermore, we inferred absolute divergence times as well as demographic changes using secondary calibrations and investigated the diversity within major lineages using haplotype networks as well as several geographical and genetic clustering methods. Results: We found eight well differentiated lineages, each of which being confined to a particular geographic region. The onset of the freshwater blenny radiation was dated around the Messinian salinity crisis. Further differentiation happened during the Plio- and Pleistocene with signatures of population expansion after the Last Glacial Maximum in some of the main lineages. Main Conclusions: Due to their unusual widespread distribution, the freshwater blennies represent an excellent model for studying phylogeographic structure across the Mediterranean basin biodiversity hotspot. The extant diversity and distribution of the freshwater Salaria species mirrors
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».